Diesmal dreht sich die Kleine Aktion der 2nd Wave um DrugDiscovery@Home. Es handelt sich nicht um einen Notfall, aber jeder ist herzlich eingeladen an dieser Aktion teilzunehmen.

Die Aktion ist geplant vom 23. Juni bis zur nächsten PG-Challenge am 25. Juli.

Wünschenswert wäre es wenn jeder Teilnehmer im Projekt ein Profil hätte.

Anwendungen gibt es für Windows (32 Bit), Linux (32 u. 64 Bit) und MacOS.

Mehr Infos über DrugDiscovery@Home findest du hier:

• DrugDiscovery@Home Wiki
• DrugDiscovery@Home Webseite
• SG-Team-Beitritt DrugDiscovery@Home
• Serverstatus
• Projektthread im SG-Forum

Das Help Conquer Cancer-Projekt des World Community Grids beschäftigt sich mit der Bildanalyse und Klassifizierung von Proteinkristallisation:

Es soll ein Analysesystem entstehen, dass die zermürbende Arbeit, die bislang nur von Menschen durchgeführt werden konnte, automatisiert. Dieses würde die Arbeit vereinfachen und beschleunigen und könnte ebenfalls Auswirkungen auf andere Forschungsbereiche haben.

Folgendes Video haben wir mit deutschen Untertiteln versehen:
[youtube Vz-_SsiiBnE]
(Danke an roundup für die Übersetzung)

Im Mittelpunkt des Help Conquer Cancer Projekts stehen Proteine, die mit Krebs in Verbindung stehen. Durch die automatisierte Analyse können mehr Proteine untersucht werden, wodurch unser Verständnis dieser Erkrankung in den verschiedenen Krankheitsstadien steigt.

Schon heute  erkennt das Analysesystem:

• 80% der Bilder mit Kristallen richtig sowie
• 89% der Bilder mit Unreinheiten und
• 98% der Bilder ohne Kristallisation.

Weblinks:

• Diskussionsthread im SG Forum
• Help Conquer Cancer Wiki-Seite
• Video mit deutschen Untertitel
• Pressemitteilung zum aktuellen Zwischenbericht des HCC-Projekts (engl.)

Mit dem großen Sieg in der letzten Challenge haben wir gezeigt, dass dies nicht die SETI.USA-Gala, sondern die PrimeGrid Challenge Series ist. Das große Ziel, alle Challenges in diesem Jahr zu gewinnen, kann SETI.USA schon einmal nicht mehr erreichen. Nun steht die nächste Challenge vor der Tür, die sicherlich nicht einfacher werden wird, aber dennoch die erste Chance für uns ist, wieder die Führung in der Gesamtwertung zu übernehmen:

The Summer Solstice Challenge
Beginn: 16.06.2010, 11:28 UTC = 12:28 MEZ = 13:28 MESZ
Ende: 21.06.2010, 11:28 UTC = 12:28 MEZ = 13:28 MESZ
Subprojekt: The Riesel Problem (Sieve)

Der offizielle Thread zur Challenge im PrimeGrid-Forum ist hier zu finden.

Es zählen für diese Challenge nur WUs vom Subprojekt The Riesel Problem (Sieve), die nach dem 16.06. um 13:28 Uhr heruntergeladen und vor dem 21.06. um 13:28 Uhr zurückgemeldet werden! Bitte die ungewöhnliche Startzeit beachten, das ist kein Schreibfehler!

Das richtige Subprojekt kann in den PrimeGrid-Einstellungen festgelegt werden.

Eine Anwendung gibt es für Windows, Linux und MacOS (Intel), jeweils 32bit und 64bit. Die 64bit-App ist im Durchschnitt 70% schneller als die 32bit-App, also ist ein 64bit-Betriebssystem sehr zu empfehlen.

Die WUs laufen ~3 Stunden auf meinem Q9450 @ 3,2GHz mit Win 7 x64. Quorum ist 1, die Credits sind fest (280 pro WU). Da die Credits fest sind, gibt es für diese Challenge keine besonderen Challenge Points; es werden einfach die Credits zusammengezählt.

Noch eine große Bitte an alle, um dem Server und euch selbst zu helfen:
Für die Berechnung wird eine ca. 35MB große Datei (das Sievefile) benötigt. Wenn nun zu Challengebeginn mehrere hundert Rechner gleichzeitig diese Datei herunterladen würden, wäre die Leitung zum Server wohl dicht und der Download würde ziemlich langsam vorangehen. Sorgt daher bitte dafür, dass ihr die Datei TRP_20100604.sieveinput bereits vorher auf dem Rechner habt, und zwar im BOINC-Datenverzeichnis unter projectswww.primegrid.com. Dazu gibt es zwei Möglichkeiten:
1. Bereits vor der Challenge ein paar TRP-Sieve-WUs crunchen, damit das Sievefile heruntergeladen wird.
2. Das Sievefile manuell herunterladen: http://www.primegrid.com/download/TR…604.sieveinput

Wenn ihr die Datei bereits auf einem Rechner habt, könnt ihr sie von dort auch einfach auf andere Rechner kopieren. Wenn die Datei im richtigen Verzeichnis liegt, wird BOINC das beim Downloadversuch merken und etwa folgende Meldung ausgeben: “File TRP_20100607.sieveinput exists already, skipping download”.

Links zu den Statistiken gibt es zu Challenge-Beginn. Diskussion bitte diesem Thread.