Superlink@Technion

Damit dieses Projekt nicht in Vergessenheit gerät, mache ich hier im neuen Forum mal einen neuen Thread dazu auf.

Zu erreichen ist dieses BOINC-Projekt des Computational Biology Laboratory, Technion, Israel, unter http://cbl-link02.cs.technion.ac.il/...inkattechnion/.

Von der Homepage:

Superlink@Technion helps geneticists all over the world find disease-provoking genes causing some types of diabetes, hypertension (high blood pressure), cancer, schizophrenia and many others.

auf Deutsch:

Superlink@Technion hilft Genetikern auf der ganzen Welt, Gene zu finden, die Krankheiten wie Diabetis, Bluthochdruck, Krebs, Schizophrenie und viele andere hervorrufen.

Das Projekt hat Anwendungen für Windows (32bit) und Linux (32+64bit). Es werden 700 MB RAM pro WU benötigt, also muss man gerade auf Multicore-Rechnern schauen, dass auch genug RAM vorhanden ist oder zumindest ein Ausweichprojekt bereit steht, damit auch alle Kerne rechnen.

Achtung: WU-Länge von ~ 3 Stunden und 28 Stunden Deadline bringen BOINC sehr leicht in den Earliest-Deadline-First-Modus.

Herzlich Willkommen im inzwischen 19-köpfigen Team (SG) bei Superlink:
-Science@Familie-Net
-Besim Karadeniz
-Cyberacid
x)

Allen Neuen ein Herzliches Willkommen!

Dies Projekt zwingt den Rechner echt an die Grenzen. Ich schiebe meist ein paar WUs an, wenn ich ne Weile nicht an den Rechner muss....
Rechnet alle mit, wenn ihr noch Kapazitäten freihabt.

anthropisches

Achtung! Nicht wundern, wenn ihr jetzt für kurze Zeit keine WUs erhaltet!
Von der Startseite:

Jul 8, 2007 First batch of jobs is close to the end
The first batch of 100,000 jobs is almost over. In order to analyze the system behavior towards the end of the queue, we will refill the queue once all tasks are over..

Zu deutsch:

08.07.2007 Erster Arbeits-Abschnitt kurz vor Vollendung
Die ersten 100.000 Workunits sind fast fertig gerechnet. Um das Verhalten des Systems am Ende der WU-Warteschleife zu analysieren, werden wir die Schleife wieder füllen, sobald alle Aufgaben beendet sind..

Seit gestern gibt es wieder Arbeit:

Jul 12, 2007 Second batch of jobs is started
The second batch of ~500,000 jobs has been started. These workunits may have different runtime (from few to dozens of minutes) and different memory requirements.

Deutsch:

12.07.2007 Zweite WU-Reihe ist gestartet
Die zweite Reihe mit ~500.000 WUs wurde begonnen. Diese WUs könnten verschiedene Laufzeiten (von wenigen bis einigen Dutzend Minuten) und verschiedene RAM-Anforderungen haben.

Also gibt's wieder genug Stoff zum Crunchen.

Willkommen im Team (SG) bei Superlink@Technion:
-Molotow
x)

Habe jetzt zum erweiterten Test auch mal einen Athlon und einen Quad drin als Zweit-/Drittprojekt.

Mal sehen, wie die Creds dafür ausfalen

Gruß Jörg

Zitat von marodeur6[SPEG]

Habe jetzt zum erweiterten Test auch mal einen Athlon und einen Quad drin als Zweit-/Drittprojekt.

Gib's zu, eigentlich willst du nur nicht mehr hinter mir in den dortigen Stats stehen...
Jetzt müsste ich ja schon tagelang dort crunchen, um dich wieder einzuholen, zumal ich auch nur ein Notebook mit genügend RAM hätte.

Herzlich Willkommen im Team (SG) bei Superlink@Technion, [SG] Radi!

Zitat von pschoefer[SPEG]

Gib's zu, eigentlich willst du nur nicht mehr hinter mir in den dortigen Stats stehen...

hrhrhr...

Nie... wäre ich auf diese Idee gekommen... aber jetzt, wo du es sagst

Gruß Jörg

Seit zwei Tagen gibt es nun die neue Version 4.71 für Windows, mit der vor allem einige Schönheitsfehler behoben wurden. Die Fortschrittsanzeige ist zumindest bei den längeren WUs jetzt halbwegs korrekt und die verbleibende Zeit hat nicht mehr so unrealistische Werte wie 200 Jahre.

Herzlich Willkommen im Team (SG) bei Superlink@Technion, Stefan!x)

Die aktuellen News von der Startseite:

Zitat von http://cbl-link02.cs.technion.ac.il/superlinkattechnion/

Jul 18, 2007 Front page, Windows version
Front page layout changed slightly, system requirements added; Superlink v4.73 released, packed with msvcp71.dll and msvcr71.dll.

Deutsch:
18.07.2007: Startseite, Windows Version
Das Layout der Startseite wurde leicht verändert, die Systemanforderungen hinzugefügt; Superlink v4.73 ist veröffentlicht, gepackt mit msvcp71.dll und msvcr71.dll.

Wer Probleme mit dem WU-Download hatte, weil die dlls in der Firewall kleben blieben o.Ä., sollte das nun nicht mehr haben.

Es empfiehlt sich übrigens, in den Globalen Einstellungen "Leave applications in memory" auf "yes" zu setzen, da die App dem BOINC Client vortäuscht, Checkpoints zu schreiben, weshalb eventuell gerade dann eine WU eines anderen Projektes begonnen wird und die Superlink-App aus dem Speicher fliegt, wodurch sämtlicher Fortschritt zunichte gemacht würde.

Herzlich Willkommen im Team (SG) bei Superlink@Technion, (M)TRONICS SCS!

Heute mal keine großen Neuigkeiten vom Projekt, aber zwei weitere Neuzugänge im Team (SG) bei Superlink@Technion:
-Niederhaus
-Sequencer

Herzlich Willkommen und Happy Crunching!

Damit hat das Team nun 25 Mitglieder!

Heute mal ein paar kleine Statistiken zum Projekt:
Nach gut 14 Tagen sind jetzt noch 140556 von den 500000 WUs der zweiten Generation übrig. Das Projekt hat inzwischen 1083 Teilnehmer mit 1999 Computern. In den letzten vier Wochen kamen dem Projekt 2800 Tage CPU-Zeit zu Gute, insgesamt sind das bisher gute zehn Jahre.

Und noch ein Herzliches Willkommen an die Mitglieder Nr. 26 und 27 im Team (SG) bei Superlink@Technion:
-Olaf-Opteron
-usch65
x)

Im Moment arbeitet Superlink daran, die kürzeste WU-Dauer herauszufinden. Und das hat die durchschlagende Wirkung, dass viele WUs heute in unter einer Sekunde beendet waren und viele Rechner das tägliche WU-Maximum von 500 Stück erreicht haben. Naja, das ist eben Beta.

Herzlich Willkommen im Team (SG) bei Superlink@Technion, Tim!

Klasse, da wollte ich auch mal ein paar WUs für Superlink rechnen, aber da Projekt scheint wohl down zu sein. Werd's später nochmal versuchen...

Zitat von Joey

Klasse, da wollte ich auch mal ein paar WUs für Superlink rechnen, aber da Projekt scheint wohl down zu sein. Werd's später nochmal versuchen...

Ja, ich habe auch schon den ganzen Tag Probleme, nicht einmal die Website ist erreichbar. Ist offenbar ein MySQL-Fehler:

Unable to connect to database - please try again later Error: 2002Can't connect to local MySQL server through socket '/var/lib/mysql/mysql.sock' (2)

Und hier ist auch der Grund für die nicht vorhandene Erreichbarkeit, und es ist leider kein leichtes Problem.

Zitat von Mark Silberstein auf http://de.boincstats.com/forum/forum_thread.php?id=2375

Hi all SUPERLINK@TECHNION crunchers,

Those who may be wondering what's going on with SUPERLINK@TECHNION - we are experiencing
complete HDD crash, and it will take us about one week to recover from it. We have backups, so maybe we'll be back sooner than that.

Sorry for this disruption,

Mark

Auf Deutsch:
Hallo alle Superlink@Technion-Cruncher.
An die, die sich fragen, was mit Superlink los ist - wir haben einen kompletten Festplatten-Crash erlitten und es wird etwa eine Woche dauern, bis wir das behoben haben. Wir haben Backups, also sind wir vielleicht auch früher wieder zurück.
Entschuldigung für diese Unterbrechung,
Mark

Also hoffen wir mal das beste.

News von der wieder erreichbaren Homepage:

Zitat von http://cbl-link02.cs.technion.ac.il/superlinkattechnion/

Aug 10, 2007 Recovering after the crash
After more than 2 weeks of downtime, we started recovering after the disk crash, the web site is up, but there will be no WUs until further notice; users are kindly requested to reload their images and avatars, sorry for the temporary inconvenience.

Zitat von auf Deutsch:

10.08.2007 Widerherstellung nach dem Crash
Nach mehr als zwei Wochen Auszeit haben wir das Wiederherstellen nach dem Festplatten-Crash begonnen; die Website ist erreichbar, aber es wird bis auf Weiteres keine WUs geben; die User werden gebeten, ihre Profilbilder und Avatare neu hochzuladen, Entschuldigung für die temporären Unannehmlichkeiten.

Zitat von http://cbl-link02.cs.technion.ac.il/superlinkattechnion/

Aug 11,2007 Recovery status
Current status of the project after the server crash is available here.

Zitat von auf Deutsch:

11.08.2007 Status der Wiederherstellung
Der aktuelle Status des Projektes ist hier nachzulesen.

Und aus dem Thread:

Zitat von http://cbl-link02.cs.technion.ac.il/superlinkattechnion/forum_thread.php?id=87&nowrap=true#757

Below are the issues we are still having because of the server crash:

1. User profiles: your pictures and avatars are lost
2. Users who joined our project during the week between 25th of July to the 2nd of August are likely to be lost. We encourage you to sign in again, as if you are singing in for the first time
3. Credit: credits got lost, but we will try to restore them from the BOINCstat and alike external sites who may have a more recent copy
4. New WUs will not be invoked until we restore some part of our development environment, which also disappeared. Anyone still having our WUs executing, please delete them, unfortunately the output from the last batch of ~350,000 jobs is lost.

We are working on a decent backup plan and simulate failures and restorations, as well as fortify the hardware to make sure that the future failures will not cause such a loss of data and long downtime.

Zitat von auf Deutsch:

Das sind die Punkte, die nach dem Server-Crash noch bereinigt werden müssen:

1. Benutzerprofile: Alle Profilbilder und Avatare sind futsch.
2. Benutzer, die in der Woche vom 25.07. bis 02.08. dem Projekt beigetreten sind, sind wahrscheinlich ebenfalls futsch. Sie möchten bitte einen neuen Account erstellen, als sei es der erste Versuch.
3. Credits: Einige Credits sind futsch, aber wir werden versuchen, diese mit Hilfe von BOINCstats und anderen externen Stats-Seiten, die eventuell neuere Werte haben, wiederherzustellen.
4. Neue WUs werden nicht in Umlauf kommen, bevor wir einen ebenfalls verschwundenen Teil unserer Entwicklungsumgebung wiederhergestellt haben. Wer noch WUs von uns hat, möge diese löschen; leider sind die Ergebnisse der letzten ~350.000 Berechnungen verloren gegangen.

Wir arbeiten an einem vernünftigen Backup-Plan und simulieren Fehler und Wiederherstellungen, so wie wir die Hardware stärken, um sicher zu stellen, dass zukünftige Fehler nicht solch einen Verlust an Daten und eine so lange Auszeit verursachen.

Punkt 3 der o.g. Liste ist schon erledigt.

Zitat von http://cbl-link02.cs.technion.ac.il/superlinkattechnion/

Aug 12, 2007 Credits recovered
Credits for all the users, teams and hosts are recovered up to July, 25th, thanks to the webmaster of BOINCstats.com.

Zitat von auf Deutsch:

12.08.2007 Credits wiederhergestellt
Die Credits aller User, Teams und Hosts bis zum 25.07. sind wiederhergestellt. Danke an den Webmaster von BOINCstats.com

Also Danke an den Willy!

Außerdem darf ich Joey im Team (SG) bei Superlink@Technion Willkommen heißen!
Der Tim ist wieder aus der Liste verschwunden; da ist wohl der Account verloren gegangen.

Zitat von pschoefer[SPEG]

...
Außerdem darf ich Joey im Team SETI.Germany bei Superlink@Technion Willkommen heißen!
...

Danke, danke. Hab mich ganz heimlich, still und leise angemeldet und dachte, es bekommt keiner mit.
Warte nur noch darauf, dass die neuen WUs endlich kommen.

Da ist bei der Creditwiederherstellung wohl was schiefgelaufen. Obwohl ich mich erst gestern für das Projekt registriert habe und es ja schon eine ganze Weile offline ist, habe ich trotzdem Credits bekommen.

Hier ist der Beweis.
Ist zwar nicht viel, aber immerhin eine nette Geste von den Superlink-Admins.

Zitat von Joey

Da ist bei der Creditwiederherstellung wohl was schiefgelaufen. Obwohl ich mich erst gestern für das Projekt registriert habe und es ja schon eine ganze Weile offline ist, habe ich trotzdem Credits bekommen.

Hier ist der Beweis.
Ist zwar nicht viel, aber immerhin eine nette Geste von den Superlink-Admins.

Ich kann mir vorstellen, woran das liegt...
Da wird wohl jemand gecruncht haben, der sich am 25.07. angemeldet hat, kurz vorm letzten Export ein paar WUs abgeliefert hat, und dessen Account verloren gegangen ist. Und nun hast du zufällig diese Account-ID erhalten.

Zitat von MarkS, [url

http://cbl-link02.cs.technion.ac.il/superlinkattechnion/forum_thread.php?id=87&nowrap=true#841]I[/url] am hopeful we will bring it up by the end of Aug. This is our plan. Hope we'll meet our own goals.

Zitat von auf Deutsch

Ich hoffe, dass wir das Projekt bis Ende August wieder zum Laufen bringen. Das ist unser Plan. Hoffentlich erfüllen wir unsere eigenen Ziele

Es wird also möglicherweise noch in dieser Woche weitergehen.

Herzlich Willkommen im Team (SG) bei Superlink@Technion, rover!

Falls es nicht schon von selber bemerkt wurde - Superlink@Technion hat seit gestern wieder "geöffnet" - es gibt also wieder WU's - die aber auch schon mal ÜBER die 100% Marke laufen!
Viel Spaß!x)

Diesen ultrakurzen WUs (< 10 Sekunden) sind schon ziemlich nervig, zumal ich immer folgende Meldung bekomme:

03.09.2007 12:18:50|superlinkattechnion|Message from server: (won't finish in time) Computer on 100.0% of time, BOINC on 0.3% of that, this project gets 99.7% of that

D.h. er lädt sich immer 2 WUs runter und sobald eine hochgeladen ist, holt er sich eine neue, da das Hochladen aber schonmal ein Weilchen dauern kann, hab ich ständig Leerlauf.

Zitat von usch65

Falls es nicht schon von selber bemerkt wurde - Superlink@Technion hat seit gestern wieder "geöffnet"

Hier ist das offizielle Statement von der HP dazu:

Zitat von http://cbl-link02.cs.technion.ac.il/superlinkattechnion/

Sep 2, 2007 Server backend started
Server backend started after a long break, database refilled with a new run (~56K wus).

Zitat von auf Deutsch

02.09.2007 Server-Backend gestartet
Das Server-Backend läuft nach einer langen Pause wieder und die Datenbank ist mit einem neuen Lauf (~56k WUs) gefüllt.

Zitat von Joey[SPEG]

Diesen ultrakurzen WUs (< 10 Sekunden) sind schon ziemlich nervig, zumal ich immer folgende Meldung bekomme:

03.09.2007 12:18:50|superlinkattechnion|Message from server: (won't finish in time) Computer on 100.0% of time, BOINC on 0.3% of that, this project gets 99.7% of that

D.h. er lädt sich immer 2 WUs runter und sobald eine hochgeladen ist, holt er sich eine neue, da das Hochladen aber schonmal ein Weilchen dauern kann, hab ich ständig Leerlauf.

Das liegt an der kurzen Deadline. 24 Stunden sind einfach zu kurz, zumal das schon mit der normalen Funktionsweise des Client-Schedulers ab 5.8.x in Konflikt gerät und alle Superlink-WUs sofort in Deadline-Trouble bringt.