POEM@Home

Unsere P3D Freunde haben dazu auch was schönes gebastelt.
Viel Erfolg allen Teams bei dem Race.

SG momentan auf #8, Power muss her.

Zitat von Carnal[SPEG]

Unsere P3D Freunde haben dazu auch was schönes gebastelt.
Viel Erfolg allen Teams bei dem Race.

SG momentan auf #8, Power muss her.

aufauf jungs und mädels, ihr seit momentan auf #9 mit nur knappen 20k tagesleistung. da muss doch noch was gehen
Helft POEM beim casp08!

Zitat von heavy-Ions@boinc

aufauf jungs und mädels, ihr seit momentan auf #9 mit nur knappen 20k tagesleistung. da muss doch noch was gehen
Helft POEM beim casp08!

Immer ruhig mit den Pferden, wir kommen später, dann aber gewaltig.

VG Jeeper

Zitat von Jeeper74[SPEG]

Immer ruhig mit den Pferden, wir kommen später, dann aber gewaltig.

VG Jeeper

Laßt Euch noch etwas Zeit, es eilt nicht.
yoyo

Ich hab heute den ganzen Tag mein Zugpferd rechnen lassen, aber irgendwas scheint schief gegangen zu sein. Ich habe bei meinen WUs überall Outcome: Client detached, obwohl ich nichts detached habe. Es scheinen auch garnicht alle WUs verzeichnet zu sein, die ich gerechnet habe. Credits gab es auch keine. Dürften dann locker 20WUs durchn Schornstein geraucht sein.
Ich habe einfach mal die neuste BOINC Version installiert (ging leider nur die 5.10.45, die neue testing darf nicht auf Domain Controllern installiert werden ) und das Projekt neu angemeldet. Hoffe es geht jetzt wieder und ich kann wieder in den sorgenlosen 24/7 Betrieb wechseln.

pfff...Platz 9 das wollen wir erstmal sehen

Zitat von Peacebreaker

Ich hab heute den ganzen Tag mein Zugpferd rechnen lassen, aber irgendwas scheint schief gegangen zu sein. Ich habe bei meinen WUs überall Outcome: Client detached, obwohl ich nichts detached habe. Es scheinen auch garnicht alle WUs verzeichnet zu sein, die ich gerechnet habe. Credits gab es auch keine. Dürften dann locker 20WUs durchn Schornstein geraucht sein.
Ich habe einfach mal die neuste BOINC Version installiert (ging leider nur die 5.10.45, die neue testing darf nicht auf Domain Controllern installiert werden ) und das Projekt neu angemeldet. Hoffe es geht jetzt wieder und ich kann wieder in den sorgenlosen 24/7 Betrieb wechseln.

pfff...Platz 9 das wollen wir erstmal sehen

Und ich wunder mich schon wo die 20 wus auf meinem account herkommen
yoyo

Oct 7, 2008 - Maintenance on friday, Oct. 10

POEM@HOME will be down for maintenance this coming friday, the 10. of October. Especially the race held to enable us participate in this year's CASP benchmark pushed our server to its memory limits. We will therefore upgrade the main memory of POEM@HOME from a mere 4GB to a total of 16GB.
If everything goes well POEM@HOME should go down at 11:00 (GMT+2) and be back up again and ready to crunch in a 4 hour timeframe.

POEM@HOME wird am kommenden 10. Oktober aus Wartungsgründen aus sein. Insbesondere das Rennen zur Hilfe beim diesjährigen CASP hat unseren Server an seine Speichergrenzen gebracht. Wir werden den Hauptspeicher von gerade mal 4GB auf 16GB aufstocken.
Wenn alles gut geht werden wir gegen 11:00 Uhr Ortszeit abschalten und ungefähr 4 Stunden später wieder erreichbar und rechenwillig sein.

Zitat von Saenger

...und rechenwillig sein.

Das sind ja wohl eher WIR, nicht die, oder nicht

Die haben auch genug Power im Hintergrund die mitrechnet

Professor Wenzel hat folgendes im Forum geschrieben:

Yes, plenty:

1) From CASP we learned that POEM is really great in quality assessment. On this basis we will implement a continues web-service, which biologist can use to assess protein structure.

2) We also learned that our protocol did not generate enough new structures in the de novo fold category. So in the next two years we will work hard to improve this protocol for the next CASP.

3) We have already succeeded (with POEM@HOME) to identify a gene responsible for a late-stage developmental disorder. This affects 1 in 10000 births, so we are very proud to develop analysis tools that actually help people right now. Obviously we will strive to continue this effort. (results update coming soon).

4) We will go back to the folding studies: POEM@HOME has folded several proteins, but now that CASP is over, we will go back to improving these algorithms.

5) .... 99) Many more ideas, not enough manpower. We keep you posted.

Thanks for your continuous support.

WW

Ich zitiere die Übersetzung mal von sanhaji aus dem RKN-Forum (Danke für Hinweis und Übersetzung):

1) Aus CASP hat man gelernt, dass die Stärken von POEM in der Qualitätsbestimmung von Proteinen liegt(Verbesserung existenter Strukturen). Deshalb plant das Team einen Internet Service für Biologen, die dort Proteinstrukturen berechnen lassen können.

2) Zusätzlich hat man gemerkt, dass das verwendete Protokoll nicht genug Strukturen für neue Proteine (also Proteine, zu denen es noch keine Strukturen gibt) generiert. Das Team arbeitet hart daran das Protokoll zum nächsten CASP in 2 Jahren zu verbessern.

3) Mit POEM@Home wurde ein menschliches Gen identifiziert, das verantwortlich für eine Störung in der fortgeschrittenen embryonalen Entwicklungsphase ist.
Diese Störung betrifft 1 in 10000 Geburten. Das POEM Team ist sehr stolz darauf, dass sie Analyse-Werkzeuge geschaffen haben, die tatsächlich schon Menschen helfen. Sie stengen sich an, diese Leistung weiterzuführen. (Ein Update der "Results" Rubrik auf der Homepage folgt bald)

4) Nachdem CASP08 nun abgeschlossen ist, wird man weiterhin Proteinfaltungen untersuchen. Die Forschungsgruppe arbeitet an der Verbesserung der verwendeten Algorithmen.

5)..99) Die Forscher haben noch viele gute Ideen aber nicht genug Mitarbeiter um sie alle umzusetzen. Sie werden uns auf dem laufenden halten.

Nicht zuletzt durch das Adventscrunchen hat SETI.Germany die 10 Millionen Cobblestones bei POEM@HOME durchbrochen.

Jupp, das ist schon was ordentliches

Schade, das es wohl innerhalb des Adventscrunches nicht für den 7 Platz reichen wird

VG Volker

Wie seit heute im (engl. und deutschen) Forum bei Poem zu lesen ist,
wurde eine neuer Client herausgegeben - POEM 1.00.

Timo, der Projektadmin, schreibt dazu:

Hallo zusammen,

in Anbetracht des POEM-Benefiz releasen wir heute einen neuen Client. Auf der wissenschaftlichen Seite haben wir zwei neue Features implementiert:

a) ein besseres Handling kurzer Peptide
und
b) eine Möglichkeit der Extraktion hydrophober Oberflächen auf einer pro-Aminosäure Basis.

Das ganze wird uns bei dem Projekt, welches wir nun beim Benefiz durchführen wollen sehr helfen. Das Projekt wird unter dem Workunitnamen "peptide" laufen und am Montag auf der Webseite vorgestellt werden.

Danke für eure Unterstützung,
Timo

Habe gerade festgestellt, daß das Charity-team in Poem die höchste Creditausbeute von allen Teams heute hatte. Ich kann nur sagen, daß dass ein Top-Erfolg ist, und nur empfehlen so weiter zu machen.

Hab mir gerade die Boincstats- Statistik angeschaut. Wirklich beeindruckend, was mit dem Charity-Team auf die Beine gestellt worden ist. Wenn das so weiter geht, ist in der zweiten Woche aber der 8.Platz von Seti.Germany in Gefahr. Wo liegen dann eigentlich die Prioritäten? Wie auch immer, der Gewinner ist auf jeden Fall das Projekt.

Zitat von Bernd Vogler

Wenn das so weiter geht, ist in der zweiten Woche aber der 8.Platz von Seti.Germany in Gefahr. Wo liegen dann eigentlich die Prioritäten? Wie auch immer, der Gewinner ist auf jeden Fall das Projekt.

Die Priorität hat i.M. ganz eindeutig das Charity-Team. Siehst du schon daran wie viele von uns "alten Hasen", welche niemals an ein verlassen von SETI.Germany gedacht hätten, mit dabei sind.
Manchmal ist es eben so, dass die Eltern von ihren eigenen Kindern überflügelt werden.
Nach dem Race können wir das ja wieder richten.

So ist es go charity go

Ich bin ja noch nicht so lange wieder bei BOINC und bei POEM@home erst seit einiger Zeit.
Kann es sein, das der POEM.server nicht so gerade voll zuverlässig ist? Laut Serverstatus ist alles i.o. aber mein BOIC sagt: NO WORK SENT.

hat jemand eine Ahnung warum, oder ist das Normal?

mfg
Morgoth

Zitat von Morgoth

Ich bin ja noch nicht so lange wieder bei BOINC und bei POEM@home erst seit einiger Zeit.
Kann es sein, das der POEM.server nicht so gerade voll zuverlässig ist? Laut Serverstatus ist alles i.o. aber mein BOIC sagt: NO WORK SENT.

hat jemand eine Ahnung warum, oder ist das Normal?

mfg
Morgoth

"no work sent" kann viele Ursachen haben
- Bunker ist/ist für boinc-client voll
- Projekt hat atm keine Arbeit (EDIT:

Zitat von server_status

Results ready to send 13,920

sollte genug da sein)

Forderst du Arbeit an (in der Zeile davor sollte requesting work >0 sein ) ?
Wie große ist dein Bunker (zusätzlicher Arbeitspuffer wie groß) ?
Welche boinc-Version verwendest du ?

Ich brauche mehr Details

Ich fordere Arbeit an und meine BOINC Version ist 6. 6.41

Warscheinlich ist mein Bunker voll oder? Den bei Einstein@home und WCG@home hab ich noch recht viele offene WUs.
Warscheinlich lösst sich das Problem von alleine. Aber dank dir für deine Antwort.

by Morgoth

Ja, wenn du die Projekte aktiv lässt und abwartest, wird sich das nach und nach einpendeln. Schneller kann es gehen, wenn du Einstein und/oder WCG (vorübergehend) auf "Keine neue Aufgabe" setzt.

Der POEM Server selbst ist sehr stabil und liefert zuverlässig Arbeit, so dass hier keine Probleme entstehen dürften.

So geht wieder alles so wie ich will. Lag an der Bunkergröße hab ich zu klein eingestellt und musste die erst wieder vergrößern.

by Morgoth

Um diesen Thread mal ein bißchen zu entstauben, es gibt spannende Neuigkeiten auf der POEM Homepage:

English: The big moment has come. We plan to release the first CPU client of POEM++ on Thursday the 16th of September. On this day we will release the Linux 64BIT client, followed by the Windows 32BIT on Friday the 17th (if there are no major regressions found, which we will report on.) If this also goes well the Windows 64BIT and Linux 32BIT clients will follow the 27th and 28th. GPU applications are also in the pipeline, but we won't give any releasedate, until the CPU app is proven to work stable on POEM@HOME. Thanks for your enormous patience.
Deutsch: Es ist soweit: Die ersten CPU Clients von POEM++ werden Donnerstag den 16. September veroeffentlicht. Zuerst werden wir den LINUX 64BIT Client, gefolgt vom Windows 32BIT Client am 17.09. hochladen (sofern es keine grossen Probleme beim Release gibt). Anschliessend werden Windows 64BIT und Linux 32BIT Clients am 27. und 28. herausgegeben. GPU Applikationen sind auch weit vorangeschritten, allerdings werden wir hier kein definitives Releasedate geben, bis wir wissen, dass die CPU Applikationen samt Server stabil auf POEM@HOME laufen. Danke fuer eure enorme Geduld beim Warten.

Na, da tut sich ja einiges.

Die Linux 64bit Anwendung für POEM++ steht wie ankündigt zur Verfügung, für morgen ist eine 32bit Windows Anwendung angekündigt.

Auch wenn's mir im Moment schwer fällt, trockene Projektnews zu posten, jene hier erscheinen mir doch wichtig:

1. Die Windows Anwendung für POEM++ konnte heute nicht mehr ganz fertig gestellt werden und verzögert sich daher voraussichtlich auf Montag (20.09.).

2. Am nächsten Samstag (25.09.) findet ein Tag der offenen Tür im Karlsruher Institut für Technologie statt, an der wohl auch die Macher von POEM teilnehmen. Den Link zum sehr umfangreichen und anscheinend auch familientauglichen Programm ergänze ich mal direkt hier (PDF): http://www.kit.edu/downloads/TdoT_Programm_2010.pdf