Cafe QMC (News, Begrüßungen, SmallTalk zum Projekt & ...)

kann man auch anders interpretieren:

man erkennt daran, welche Teams ihren Schwerpunkt auf welche Projekte (oder anders ausgedrückt: welche Teams ihren Schwerpunkt auf einige wenige Projekte) und/oder Credits legen.

Daran erkenne ich, dass ich mit meiner Wahl absolut richtig liege.

So setzt jeder seine Prioritäten anders.

Ausserdem willst Du mir (und den anderen hier Anwesenden/Mitlesenden) nicht verkaufen, dass das nur auf Euren QMC-Thread basiert und nicht etwa auf einer internen "Mobilmachung" der Kavallerie.

Zitat von Major

kann man auch anders interpretieren:

man erkennt daran, welche Teams ihren Schwerpunkt auf welche Projekte (oder anders ausgedrückt: welche Teams ihren Schwerpunkt auf einige wenige Projekte) und/oder Credits legen.

Daran erkenne ich, dass ich mit meiner Wahl absolut richtig liege.

So setzt jeder seine Prioritäten anders.

So ist es. Sicher hätte ich auch schnell einige von den WUs ziehen können, um mein Punktekonto zu ver-x-fachen. Aber ich bin lieber stolz auf meine vor einigen Jahren wirklich ercrunchten 3590.23 Credits und verzichte auf derlei Geschenke ohne Gegenwert.

Zitat von Major

[...
Ausserdem willst Du mir (und den anderen hier Anwesenden/Mitlesenden) nicht verkaufen, dass das nur auf Euren QMC-Thread basiert und nicht etwa auf einer internen "Mobilmachung" der Kavallerie.

Keine Ahnung, da bin ich nicht drin, also ich hatte das definitiv nur über den Faden (auch einen(?) Tag zu spät), was die Kavallerie macht kann ich nicht sagen, als autonomer Cruncher bin ich da nicht drin... Reicht schon wenn man mich den ganzen Tag "rumschubst", dann brauch ich das nach Dienst nicht noch und möchte selbst entscheiden was ich rechne.

PS. Wollte dich nicht abwerben

Zitat von [P3D]Emploi

[snip]... Reicht schon wenn man mich den ganzen Tag "rumschubst", dann brauch ich das nach Dienst nicht noch und möchte selbst entscheiden was ich rechne. ...[/snip]

Ich sehe wir liegen hier auf der selben Wellenlänge

Zitat von [P3D]Emploi

PS. Wollte dich nicht abwerben

ROFL ... hab ich gar nicht so gesehen, aber stimmt .... könnte man so lesen.

Hier gibt es einen solchen Fred noch nicht, also mach ich mal einen auf.
Die Stelle, an der jedermensch nachlesen kann, sogar auf deutsch, ist diese hier:
Diskussionsforen : QMC@HOME (german) : NEWS

Die letzten Meldungen lauten (für die, die zu faul sind zum klicken )

Zitat von akgrimme, Posted 12 Feb 2010 13:01:04 UTC

Hallo zusammen,

heute hab ich den ersten Test mit unserem neuen QMC BETA(!) Programm 'CASINO' (QASINO in der QMC@HOME version) gestartet, aber zunächst gibt es erstmal nur 101 Test-Workunits da draussen ... CASINO ist ein QMC-Code von der Universität Cambridge (wo ich jetzt arbeite) und macht unsere QMC-Rechnungen (hoffentlich noch) genauer, schneller und stabiler - ob das wirklich der fall ist, gilt es nun herauszufinden :-)

Mehr Infos zu CASINO, dem Beta-Test (und ein neues 'Qasino Beta'-Forum) werden ab Anfang nächster Woche zur Verfügung stehen (sagen wir mal Dienstag ...)

Viele Gruesse!
Martin

und

Zitat von waldemar, Posted 19 Jan 2010 16:02:09 UTC

Liebe QMC@HOME Gemeinde!

Ich möchte mich erstmal vorstellen. Ich bin Roberts Nachfolger und werde das Programm ORCA von nun an übernehmen und weiter pflegen.
An dieser Stelle ein großes DANKE an alle bisherigen Unterstützer von QMC@home.


Ein paar Worte zum WISSENSCHAFTlichen Teil meines Beitrages:
Ich werde ORCA dazu nutzen genaue Schwingungen von Molekülen zu berechnen.
Ich will hier kurz erklären was es sich damit auf sich hat.

Die Idee ist im Grunde sehr einfach. Stellt euch ein Molekül wie Sauerstoff zunächst in völliger Ruhe vor. Man kann es als O=O schreiben. Wenn man es nun etwas Energie in Form von Wärme zuführt, beginnt es sich zu bewegen. Es bewegt sich in allen drei Raumrichtungen x,y und z. Zusätzlich fängt es an zu rotieren und was noch wichtiger ist zu schwingen. D.h. die Bindung zwischen den Sauerstoffen wird periodisch immer etwas kürzer und länger. Wenn man das Molekül eine Weile beobachtet, sieht man, dass das Molekül mit einer festen Frequenz schwingt, wenn man die Gesamtenergie konstant hält.

Die eigentliche Herausforderung ist nun die Schwingungen von sehr großen Molekülen zu berechnen. An dieser Stelle kommt das QMC@home Projekt ins Spiel.
Ich brauche Euere Unterstützung, um diese Berechnungen durchführen zu können.

Was kann man nun mit diesen Schwingungen anfangen? Eine Menge!
Sobald wir die Schwingungsfrequenzen haben, können wir einerseits direkt ein spektroskopisches Spektrum darstellen. Aber was noch wichtiger ist man kann damit z.B. für die DNA (rein hypothetisch betrachtet) fast alle möglichen thermodynamischen Größen ausrechnen, was entscheident für chemische Reaktionen ist.

Jetzt zum TECHNISCHEN Teil:
-SCHWINGUNGEN
Um Schwingungen mit ORCA berechnen zu können, muss ich noch einige wenige anpassungen machen. Sobald ich soweit bin würde ich auch ein paar Freiwillige brauchen, die bereit wären, die neue Verison zu testen.

-CUDA
Mein Kollege Holger hat bereits ORCA Grafikkarten fähig gemacht. Ich werde seine Implementierung auf unsere ORCA Version übertragen. Damit würde CASINO und ORCA Grafikkarten Unterstützung bieten.

-BILDSCHIRMSCHONER
Unser Bildschirmschoner wurde von Jan geschrieben und betreut. Sein momentaner Job lässt leider keinen Freiraum für die Betreuung des Bildschirmschoners zu. Daher werde ich auch den Bildschirmschoner übernehmen und ihn an ORCA anpassen.


Falls noch irgendwelche Fragen offen geblieben sind, bitte zögert nicht und meldet Euch.

Zum Schluß nochmals Danke an die Unterstützer in der Vergangenheit und vor allem auch für die Zukunft. Insbesondere auch für alle hilfreichen Tipps und Tests.

Gruß,
Waldemar

Zitat von Saenger

Hier gibt es einen solchen Fred noch nicht, also mach ich mal einen auf.

Ich war kurz irritiert, als ich den Threadtitel "Neuigkeiten aus dem Projekt" unter "Neue Beiträge" gelesen habe, denn man kann zwar weiter rechts lesen, in welchem Forum der Thread gepostet wurde, so ohne Projektnamen im Titel gab es wirklich keinen Thread. Aber diesen hier Ich denke, so wie wir es in den Unterforen von ABC, PrimeGrid etc. gestaltet haben, ist es auch hier offensichtlicher.

So, habe mich heute mit einem Rechner auch angemeldet...
und spiele hier auch mit.
Mal sehen, wie es mit den "Schwingungen" (Danke saenger!) so weiter geht...
und freue mich nach der ersten WU schon auf Platz 669 der SG-Liste zu stehen...
wird schon noch...

QMC ist übriegens ganz ähnlich wie PG LLR Tests Hochleistungssport für die CPU. Also Anfangs ein bissel die Temps und Stabilität im Auge behalten.

Gruß Maik

Moin,

in der Tat: musste letztens die Vcore um 0,050 nach oben korrigieren. Die senke ich sonst immer gern weit ab, damit ich nicht zu viel Strom verschwende. Bei QMC nicht drin!

Gruß Rainer

Danke Ihr beiden!
Läuft alles rund bisher...
das Projekt läuft aber noch ein bischen nebenher, weil ich meine Power gerade auf andere lege...

gerade auf meinem schwächsten Rechner habe ich einen Cluster von 40 Std. WUs bekommen (pro WU übrigens die gleiche creditzahl von 250m;-) )

Im Moment sind gerade ein paar Orca WUs der Anwendung QMC@HOME-orca-alphabeta v5.02 im Umlauf die ca. 800-900 MB RAM benötigen.
Außerdem bewegt sich die Fortschrittsanzeige nur sprunghaft und die Boinc-Prognose der Laufzeit ist viel zu hoch.
Die gute Nachricht:
Auf meinem T5600 @ 1.83GHz sind die ersten beiden nach knapp 10 Stunden erfolgreich beendet worden.

Gruß,
Rutor

Laut hiesigem Wiki soll QMC@HOME Checkpoints setzen. Jedoch beginnt die Berechnung hier ständig bei 0,000%, sobald BOINC (6.10.56) beendet und erneut gestartet wird.

Was mache ich falsch?

Edit: Ich habe nach kurzer Suche die entsprechende Antwort bereits finden können.

Unsere Rechnungen werden variabel zwischengespeichert ('Checkpointing'). Im Moment wird eine Rechnung nach jeweils ungefähr 5-20 Minuten zwischengespeichert.

Ich bitte um Verzeihung für diesen unnötigen Beitrag.

Hallo!

Bei mir kommt kein QMC-Bildschirmschoner, ist das normal?
grüße

Hallo exx,

wenn ich mich richtig erinnere, gab es seit der Umstellung auf die Qasino Applikation Probleme mit dem Windows Screen saver, die bis heute nicht gelöst sind.
Die letzte Nachfrage dazu im QMC Forum ist vom 22. August 2010 - bisher ohne Antwort.

Gruß,
Rutor

Ah, ok. Ich kann mich nämlich dran erinnern, dass ich vor Ewigkeiten mal einen hatte.
danke

Zitat von lemarc

Laut hiesigem Wiki soll QMC@HOME Checkpoints setzen. Jedoch beginnt die Berechnung hier ständig bei 0,000%, sobald BOINC (6.10.56) beendet und erneut gestartet wird.

Was mache ich falsch?

Edit: Ich habe nach kurzer Suche die entsprechende Antwort bereits finden können.

Unsere Rechnungen werden variabel zwischengespeichert ('Checkpointing'). Im Moment wird eine Rechnung nach jeweils ungefähr 5-20 Minuten zwischengespeichert.

Ich bitte um Verzeihung für diesen unnötigen Beitrag.

Hallo lemarc,

meine Meinung: Wenn Du selber weitersuchst und dann auch noch Dein Posting um die Lösung und die Quelle ergänzt, ist der Beitrag sicher nicht unnötig.
Danke für die Info.
Mir ist der Effekt bisher nie aufgefallen, weil ich die WUs meistens durchlaufen lasse.

Schönes Wochenende,
Rutor

Hallo,

für alle die sich wundern, warum bei QMC im Moment nichts geht:

Wegen Reparaturarbeiten im Institut gibt es morgen früh keinen Strom,
der Server wird deshalb so gegen 7 Uhr für einige Stunden runtergefahren.

Entschuldigt bitte die Umstände,
Martin

Gruß,
Rutor

Seit wann bekomm ich denn so viele WUs? Ich hab hier 4 Stück, sonst gabs maximal 2. 2 laufen gleichzeitig. Haben die jetzt auch auf 1 pro Core umgestellt? Hab auf der HP nix gefunden.

Dein Bunker wohl etwas zu klein. Ich hab eigentlich immer für jeden Kern eine.

Das Limit scheinen 100 WUs pro Tag und Kern zu sein.

MrS

Hallo,

Martin ist zurück und es gibt ein News-Update zum QMC-Projekt

Zitat von News by Martin, Posted 21 Feb 2011 13:59:49 UTC

PROJECT OVERVIEW I/2011

Dear qmc-at-home supporters,

first of all: thank you very much for your continued support of our research. Our project has again seen some major changes in the last year. This little news posting should give you a short overview of what was done.

* WORKUNITS *
Because of several problems with memory and disk requirements, ORCA calculations are suspended at least for now - though they might come back in the next year if we find a way to make them more user-friendly. So we concentrated on QMC again, where we changed our main application from Amolqc to CASINO (or how our version is called; QASINO), the QMC code of the Cambridge QMC group. This change (together with a lot of stuff we found out about QMC for molecules over the last year) solved almost all our problems ... juhu! (German sound of great happiness.) The bad point: Our screensaver is not working with CASINO, so that over the last year we essentially had no screensaver graphics. I had a preliminary version with the screensaver running, but rather often the graphics got stuck at some point and crashed the workunit. This is very likely because we have not fully ported our screensaver to the updated BOINC graphics system but used a workaround. So full porting is necessary, but work time is scarce ... We are also still missing a GPU version of CASINO (preliminary tests with Amolqc went quite well, but now things have to be done again for CASINO), which should be a great boost in performance (MC problems are rather well suited for GPUs).

* QUANTUM CHEMISTRY *
a) With QASINO we were able to crunch our way through a huge number of calculations on several benchmark sets which now nicely illustrate the potential of QMC for Quantum Chemistry. Most of the data has ended up in one manuscript, that will be the core outcome of my research in Cambridge. This is the abstract:

Accurate Thermochemistry with Fixed Node Diffusion Monte Carlo
(Martin Korth and Mike D. Towler)

"A systematic study of the influence of trial wave function parameters on absolute and relative fixed node diffusion Monte Carlo (FNDMC) energies for molecular systems is presented. Effects resulting from technical parameters up to aspects in the generation of trial wave functions are examined, including the application of pseudo potentials, DFT wave functions, basis sets of increasing size, backflow terms, different Jastrow factor terms and VMC optimization methods. It is found that pseudo potential FNDMC calculations with DFT trial wave functions and mid-size basis sets reach the accuracy of the 'gold standard' CCSD(T)/cc-pVTZ method for the calculation of reaction energies (more than halving the average errors of previously published all-electron FNDMC data with Hartree-Fock trial wave functions)."

Okay, that's a lot of sciencie mojo, it basically says: We are ready to move on to real-life systems!

b) And we paid special attention to respond to a recent publication observing big differences between QMC and 'standard' Quantum Chemistry methods (as this of course would have questioned the reliability of the data presented in the manuscript above):

The lithium-thiophene riddle revisited
(Martin Korth, Stefan Grimme and M.D. Towler)

"A recent study of the interaction of a lithium atom with the thiophene molecule found a large disagreement between high-level coupled cluster (CCSD(T)/AVTZ) and quatum Monte Carlo (fixed-node diffusion Monte Carlo, or FNDMC) calculations. We address this `lithium-thiophene riddle' by analyzing the influence of crucial FNDMC simulation parameters, namely the one-electron models, basis sets, and pseudopotentials used for the generation of the trial wave function. These are shown to have a significant impact on the calculated FNDMC interaction energies and good agreement between CCSD(T) and FNDMC is found when nodal hypersurfaces of sufficient quality are used. Based on our proposed consensus reference value, we go on to benchmark the standard toolbox of lower-level quantum chemistry methods for this model interaction. Newly- eveloped dispersion-corrected DFT methods perform reasonably well despite the partial charge transfer character of the interaction and might well be worthy of further study in larger lithium-thiophene systems."

Again some sci-speak, basically saying: We know how to do it right now! (And sorry to Caffarel et al. for this very, very simplistic description of the underlying scientific problem to which both research groups have contributed.)

b)
So what will be next? The above mentioned benchmarks actually delivered a lot more results, some of which are definitely worth publishing, so that two more manuscripts will likely follow. And then? Somewhere above I said; we can now move on to 'real-life' systems - how does that work? I do not want to reveal too much, but will roughly cover one point:

Real-life systems (a protein-ligand complex, an enzyme within a catalytic cycle) are far to large to be treated with QMC (in fact every 'quantum computational' method using the computational resources available today. But there is one way around this: You can use QMC for the inner, important part of system and a lower-level (faster, less accurate) method for the outer (less important) part. Techniques like this are called QM/MM methods: QM for a (inner) quantum mechanical method and MM for an (outer) molecular modeling methods - the later one being based on a 'classical view' of what happens in a molecule, commonly used for instance for protein folding, where things have to be faaast). Our QM method will be QMC, combined with MM methods to form the new QMC/MM method, that will allow us to push QM/MM techniques to higher accuracy and (probably even more important) open them to massively parallel computations. For this I joined the work group of Walter Thiel at the MPI 'für Kohlenforschung' (Carbon or coal research - a name related to the history of this place in the middle of the Ruhrgebiet, the industrial powerhouse of Germany from before the 'Kaiserzeit' to the 70s energy crisis). Professor Thiel is one of the leading scientists in the field of QM/MM development and application.

* PROJECT STAFF *
Uh, just me again; Robert is snowed under with money in a private company and Waldemar has turned his attention to another project at least for a while. Why is noone willing to invest money into a 10-20 TFlops volunteer supercomputer? See how little money is around in science ... I should add: if you are doing Volunteer Computing, which is still not really accepted in a lot of scientific communities. But I guess you simple have other problems if you have convinced your government to build you a new supercollider ... probably even more severe problems ... =)

* PROJECT STATE *
Yeah, I guess we will never leave beta. Simply missed it at some point. are we possible the most stable beta project ever? Maybe having the screensaver available for CASINO would be a good point?

* PROJECT FUTURE *
Things I will work on in the next year are:
- Re-open QuantumFIRE alpha for QMC in physics as soon as (financially) possible
- CASINO screensaver & GPU app ...
- QMC/MM development and application to enzymatic reactions!!!

* LAST BUT NOT LEAST *
If you have any questions - please post them!

Thanks again for supporting QMC-at-HOME!
Martin

Gruß,
Rutor

Hab mir grad die ersten WUs für den Pentathlon geholt.
Laufzeiten etwa 71h. Bleibt das so, oder wird das noch nach unten korrigiert?
Drei Tage Laufzeit für eine WU lohnt sich für mich nicht.
i7 740QM - 8GB RAM - GeForce 460M

MfG
Blacky

Auf meinem Q6600 @2,4GHz unter Vista HP 32Bit und PG auf ner 250er GTS laufen die WUs zwischen 12,5 und 15h

Dann werde ich mal abwarten......

MfG
Blacky

Auf einem Phenom 9950 (2,6GHz) liegt der Durchschnitt bei 17 Stunden. Gelegentlich sind auch mal welche dazwischen, die 50% länger laufen. Das gilt für die "qasino" WUs. Die ORCAs sind unberechenbar, die liegen zwischen 60 Sekunden und 50 Stunden. Aber die hat es in letzter nicht mehr gegeben...

Bis denn dann, Grubix.