WCG: Help Fight Childhood Cancer Project

Mann Mann Mann.. Viel los beim World Community Grid. Vorgestern erst das 250.000.000te Ergebnis berechnet, Ende März/Anfang April soll die 2. Phase des Help Cure Muscular Dystrophy online gehen und trotzdem startet heute das neue Help Fight Childhood Cancer Project.

Das Projekt wird vom japanischen Chiba Cancer Center Research Institute and Chiba University durchgeführt und hat zum Ziel ein Medikament zu finden, welches die Proteine zur Bildung von Neuroblastomen außer Kraft setzt. Neuroblastome sind eine der häufigsten Krebserkrankungen im Kindesalter. ...mehr dazu bei WCG

Das WCG-Badge ist dieses


Die Mindestanforderungen sehen derzeit so aus:
* At least 250 MB RAM (with virtual memory enabled)
* 600 MB Hard Disk Drive with at least 50 MB available for use
* The ability to display 8-bit graphics at 800x600 resolution
* An Internet connection with minimum 40 kbps speed
* Operating System: Windows ME, 2000, XP, Vista, Linux, OS/X

Viel Spaß beim Crunchen!
crille

Also mir ist aufgefallen das bei diesem Projekt die Rechenzeiten extrem schwanken und sehr schnell in in die Länge zu wachsen scheinen. Meine ersten HFCC waren meist so 2-5 Stunden lang, jetzt schießen sie sich im Schnitt auf 15-19 Stunden ein. Hier mal ein paar Beispiele: 19,25h, 18,61h, 15,53h und so weiter.

Ich habe eher das Gefühl das sie weiterhin in der Rechenzeit ansteigen, mal sehen wann sie sich auf einen Höchstwert einpendeln.

Gruß bieboderbeste

Das Problem ist bei WCG bekannt und wird untersucht. Die WU's werden aber normal beendet und entsprechende Credits gutgeschrieben.
Ein Tech schrieb in diesem Thread des WCG-Forums dazu:
>>
We are looking into these larger work units to see what may be causing the estimations on them them to be off. We are hoping to find a common feature in the work units. But the work units are validating and running normally as they should.

-Uplinger
<<

Sehr gut zu wissen. Ich hatte mir halt nur wegen dem exorbitanten Anstieg Sorgen gemacht das wir bald bei 100 h liegen könnten

Aber bis jetzt sind auch alle validiert worden, es gab keine beanstandung des Servers, wie ja der Tech von WCG auch schon schrieb.

Gruß bieboderbeste

Zitat von bieboderbeste

Also mir ist aufgefallen das bei diesem Projekt die Rechenzeiten extrem schwanken und sehr schnell in in die Länge zu wachsen scheinen. Meine ersten HFCC waren meist so 2-5 Stunden lang, jetzt schießen sie sich im Schnitt auf 15-19 Stunden ein.
Gruß bieboderbeste

Das ist schon heftig

bei mir sind sie im schnitt nach 4-6 Stunden fertig, selten 3h oder wie vor kurzen knapp über 9h

hmm bisher war mir nicht bewusst das eine lange "Crunshzeit" ein Problem ist.

Gruß Lord Crazy Ivan

Yup, die Rechenzeiten auf manchen meiner älteren Kisten gingen am WE ganz schön in die Höhe...

HFCC_ s1_ 00909230_ s1_ 0000_ 0--  	Valid 	12.75 	94.3 / 79.0
HFCC_ s1_ 00908432_ s1_ 0001_ 1-- 	Valid 	15.05 	113.4 / 101.0
HFCC_ s1_ 00893981_ s1_ 0000_ 0-- 	Valid 	18.90 	139.5 / 124.4
HFCC_ s1_ 00893976_ s1_ 0001_ 0-- 	Valid 	14.16 	104.5 / 97.3
HFCC_ s1_ 00893971_ s1_ 0001_ 0-- 	Valid 	16.01 	118.2 / 111.6
HFCC_ s1_ 00893903_ s1_ 0001_ 0-- 	Valid 	10.08 	74.4 / 67.3
HFCC_ s1_ 00873747_ s1_ 0001_ 0-- 	Valid 	12.11 	89.8 / 84.3
HFCC_ s1_ 00854242_ s1_ 0001_ 0-- 	Valid  17.00 	126.3 / 111.5
HFCC_ s1_ 00835890_ s1_ 0001_ 0-- 	Valid  42.65 	319.2 / 288.0
HFCC_ s1_ 00835887_ s1_ 0000_ 0-- 	Valid 	35.43 	265.2 / 239.5
HFCC_ s1_ 00835880_ s1_ 0001_ 0-- 	Valid 35.82 	268.1 / 245.6
HFCC_ s1_ 00835876_ s1_ 0000_ 0-- 	Valid 	33.60 	251.5 / 229.7
HFCC_ s1_ 00831701_ s1_ 0000_ 0-- 	Valid 	31.86 	238.3 / 212.8
HFCC_ s1_ 00821295_ s1_ 0001_ 0-- 	Valid 	15.69 	115.8 / 97.6

HFCC_ s1_ 01135406_ s1_ 0000_ 0-- Valid 4.85 56.3 / 53.1
HFCC_ s1_ 01112275_ s1_ 0000_ 0-- Valid 7.80 90.6 / 85.7
HFCC_ s1_ 01109769_ s1_ 0001_ 0-- Valid 14.91 173.0 / 164.3
HFCC_ s1_ 01109638_ s1_ 0001_ 0-- Valid 9.28 107.7 / 104.7
HFCC_ s1_ 01109462_ s1_ 0001_ 0-- Valid 14.57 169.1 / 152.7
HFCC_ s1_ 01217131_ s1_ 0000_ 0-- Valid 16.95 198.2 / 187.3
HFCC_ s1_ 01152602_ s1_ 0001_ 0-- Valid 10.75 124.8 / 117.4
HFCC_ s1_ 01217085_ s1_ 0000_ 0-- Valid 9.71 113.5 / 101.2
HFCC_ s1_ 01217088_ s1_ 0000_ 0-- Valid 10.54 123.2 / 0.0
HFCC_ s1_ 01217081_ s1_ 0000_ 0-- Valid 9.74 113.9 / 108.1

Die Werte sind derzeit nicht mehr gänzlich so hoch, unterliegen aber massven Schwankungen.

Das kann ich so bestätigen, es läuft jetzt schon gleichmässiger

HFCC_ s1_ 01076529_ s1_ 0001_ 0-- Valid 14.12.09 09:45:47 12.20 89.3 / 82.8
HFCC_ s1_ 01075335_ s1_ 0001_ 1-- Valid 14.12.09 09:47:01 16.10 118.1 / 99.6
HFCC_ s1_ 01074106_ s1_ 0001_ 0-- Valid 15.12.09 10:43:31 17.70 131.2 / 119.0
HFCC_ s1_ 01074891_ s1_ 0001_ 0-- Valid 15.12.09 10:44:08 16.78 125.1 / 105.7
HFCC_ s1_ 01008840_ s1_ 0001_ 0-- Valid 14.12.09 09:44:06 18.72 139.4 / 119.1
HFCC_ s1_ 01007729_ s1_ 0001_ 0-- Valid 14.12.09 09:45:20 19.79 145.4 / 125.0
HFCC_ s1_ 01007619_ s1_ 0001_ 0-- Valid 14.12.09 09:45:35 19.29 141.9 / 126.1
HFCC_ s1_ 01008078_ s1_ 0001_ 0-- Valid 14.12.09 09:44:49 18.75 137.7 / 130.6
HFCC_ s1_ 01008065_ s1_ 0001_ 0-- Valid 13.12.09 23:23:36 16.54 122.7 / 108.5
HFCC_ s1_ 01007963_ s1_ 0000_ 0-- Valid 14.12.09 09:44:34 17.58 130.3 / 109.3
HFCC_ s1_ 01007867_ s1_ 0000_ 0-- Valid 14.12.09 09:43:13 17.88 132.7 / 112.1
HFCC_ s1_ 01007813_ s1_ 0000_ 0-- Valid 14.12.09 09:44:00 22.99 170.4 / 154.6
HFCC_ s1_ 01007644_ s1_ 0001_ 0-- Valid 14.12.09 09:42:35 19.15 142.2 / 124.9

Das Ziel von HFCC ist die Berechnung eines Wirkstoffes, der gegen die drei als Hauptverursacher von Krebs im Kindesalter (Neuroblastome) geltenden Proteine wirkt. Momentan berechnen wir Wirkstoffe gegen das zweite dieser Proteine (S1).
Die Wissenschafter vom Chiba Cancer Center Research Institute haben die Ergebnisse unserer Berechnungen von wirksamen Molekülen gegen das erste Protein (T1) ausgewertet und 60 potenzielle Kandidaten für Medikamente gefunden. Aus diesen Kandidaten werden zunächst 10 Wirkstoffe ausgewählt, um im Labor deren Wirkung gegen Neuroblastome zu verifizieren.
Drücken wir die Daumen für weitere erfolgreiche Tests!

Wenn es da einen Erfolg geben wird, dann ist es genau das Argument, was BOINC noch fehlt, damit könnte man viel mehr Leute dafür begeistern und schneller mehr Entwickeln.

Bin auf jedenfall gespannt.

Zitat von sgw703

Wenn es da einen Erfolg geben wird, dann ist es genau das Argument, was BOINC noch fehlt, damit könnte man viel mehr Leute dafür begeistern und schneller mehr Entwickeln.

Gerade die WCG-Projekte haben einige interessante Kandidaten für neue Medikamente entdeckt, die ohne den massiven Einsatz von Computern nicht hätten identifiziert werden können - insbesondere bei HFCC, HCMD und FAAH besteht Grund zur Hoffnung. Bei DDDT, IADS und CEP müssen wir die Ergbnisse der jeweiligen Phase 2 noch abwarten.
Ebenso würde ich den Wert von HCC für die Krebs-Diagnostik und die Arbeit von HPF und anderen Folding-Projekten (Rosetta) für das Verständnis der Funktionen des Organismus auf molekularer Ebene nicht unterschätzen. Auch dadurch schaffen wir neue Ansatzpunkte für die Forschung.

ABER: Der Prozess zur Medikamentenentwicklung ist verdammt aufwändig: Tests im Labor, präklinische Tests, Tests mit Gesunden, Tests mit Kranken, Auswertung der Tests, Entwicklung von Herstellungsverfahren und Darreichungsformen, Zulassung durch Arzneimittelbehörden (allein das kann Jahre dauern)....

Von der Entdeckung eines Wirkmoleküls bis zum Auftauchen eines Medikamentes in der Apotheke können leicht 10 Jahre vergehen. Trotzdem bin ich davon überzeugt, dass es nur eine Frage der Zeit ist, bis sich ein bedeutender Fortschritt auf das Verteilte Rechnen zurückführen läßt.

WCG läuft auf meinen Rechner immer zu mindestens 50%. Ich finde es eines der sinnvollsten Projekte, bzw. Projektsammlungen im verteilten Rechnen. Es bedarf schon immer einer Überwindung, zu den Challenge-Zeiten das Projekt vorübergehend "stillzulegen"...

Ich bin deshalb meist nur bei den Challenges vertreten, die nicht länger als 3 Tage dauern..

Ich danke dir roundup, für den "Ergebniseinblick". Ich habe selbst leider nicht viel Zeit im WCG-Forum außerhalb unserer HP zu lesen! Allein diese Tatsachen bestärkt mich mehr, dies als mein Hauptprojekt anzusehen!!

Nur so als Info für alle, die noch den ein oder anderen Batch benötigen.

Das Projekt scheint sich dem Ende zu nähern. Im Chart wird Juni 2010 als Enddatum angegeben. Fortschritt ist auch schon bei über 90%.

Gruß,
fufu

wieso diese plötzliche laufzeitverkürzung ? Bisher stand es immer Ende des Jahres wenn ich mich recht erinner. *grml*

Hatten sie nicht ne neue App geschrieben, die die Berechnungszeit auf ca 2h verkürzt hatte!!
Könnte ja daran liegen....

dann will ich mal hoffen, dass ich nach der PG-Challenge noch genug WUs bekomme um die mir noch fehlenden 300 Tage für Blau zu berechnen..

Zitat von XSmeagolX

Hatten sie nicht ne neue App geschrieben, die die Berechnungszeit auf ca 2h verkürzt hatte!!
Könnte ja daran liegen....

dann will ich mal hoffen, dass ich nach der PG-Challenge noch genug WUs bekomme um die mir noch fehlenden 300 Tage für Blau zu berechnen..

Das war bei HCC. 300 Tage fehlen mir auch noch, aber ich hab nicht so ne Flotte wie du Daher überleg ich, jetzt schon umzuschwenken.

Jop... 28.01.2010 gabs noch die Info das bis 12.2010 das Projekt etwa laufen würde

http://i137.photobucket.com/albums/q...jectsGantt.png

jetzt ist die Grafik am 24.04.2010 aktualisiert

http://i137.photobucket.com/albums/q...jectsGantt.png

jetzt nur noch bis ca Juni 2010.

Dann aber schnell nach der PG-Challenge rüber zu WCG und noch 63 Tagi Crunchen Smaragd wollte ich noch haben

Zitat von fufu

Im Chart wird Juni 2010 als Enddatum angegeben. Fortschritt ist auch schon bei über 90%.

Danke für die Info, fufu!
Der Fortschritt stand vor ein paar Tagen noch auf ~66%. Eine vernünftige Erklärung für diesen plötzlichen Fortschritt habe ich im WCG-Forum nicht gefunden.

Hier steht was von noch 30 Tagen Arbeit oder weniger

Oha, das mit dem Sapphire Badge wird ganz schön eng!

Kann das mal jemand nachlesen?
Meine Englischkenntnisse sind nicht besonders, aber ich habe es so verstanden das wir ne Warnung bekommen wenn es unter 30 Tage sinkt und wir doch nocht mehr Zeit haben. Also wohl doch eher der Juni 2010.
Also nicht nur der eine Post, sondern die ganzen zu diesem Thema.

Gruß
Markus

Es sind noch mehr als 30 Tage Arbeit da (was auch immer das heißt... Wahrscheinlich, wenn es mit dem gleichen Output weitergeht), aber es ist weniger als die Admins vorher angenommen haben, da Teile der Arbeit "out of sequence" sind (vllt sowas wie, werden nicht mehr gebraucht, da schon berechnet und/oder trivial?).

Hoffe, es ist einigermaßen richtig

Danke für die Aufklärung. So richtig beruhigt bin ich allerdings erst sobald ich mein Badge habe

geht mir genauso..

Am Freitag geht die Challenge zu Ende und dann gibts erst mal nur WCG in diesem Unterprojekt, bis ich die noch fehlenden 300 Tage zusammen habe...

Das sehe ich genauso.

Alles bleibt wie es ist, quasi: Auf sie mit Gebrüll!
(nur das es hier halt die HFCC-WUs sind )