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    von Veröffentlicht: 23.04.2018 14:20
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    Das Projekt distributedDataMining wird beendet, da die veraltete Software, auf der die Webseite basierte, eine Sicherheitslücke aufwies und der Administrator ohnehin nicht die Zeit investieren konnte, sich angemessen um das Projekt zu kümmern. Während die Webseite bereits durch die im Folgenden übersetzte Meldung ersetzt wurde, wird der BOINC-Server noch für eine Weile weiter laufen; es werden jedoch keine neuen WUs mehr generiert.

    Das Projekt distributedDataMining wird beendet!
    Liebe ddm-Teilnehmer,

    wir hatten in den letzten Jahren einen guten Lauf und die Rechenleistung, die ihr zur Verfügung gestellt habt, hat vielen Forschern geholfen, ihre wissenschaftlichen Ziele zu erreichen.

    Leider konnte ich nicht so viel Zeit in die Instandhaltung des ddm-Projektes investieren, wie ich wollte, und während der BOINC-Client die meiste Zeit gut funktionierte, gab es zunehmend Probleme mit der Seite, die nicht vernünftig behandelt wurden. Ich habe oftmals überlegt, das Projekt abzuschalten, aber es gab nie den richtigen Moment dazu.

    Das hat sich kürzlich geändert, als eine kritische Schwachstelle des Inhaltsverwaltungssystems Drupal bekanntgegeben wurde. Da die ddm-Webseite eine alte Drupal-Version verwendete, gibt es keine Lösung für dieses Problem. Daher habe ich die Webseite abgeschaltet. Es gibt keine Anzeichen, dass die Schwachstelle ausgenutzt wurde. Der eigentliche BOINC-Server läuft auf einem anderen Rechner und wäre in keinem Fall betroffen gewesen.

    Ich hatte die Wahl, entweder auf die neueste Drupal-Version zu aktualisieren mitsamt der zeitaufwendigen Re-Integration aller BOINC-Funktionen oder das Projekt endgültig abzuschalten. Ich habe entschieden, dass das der richtige Moment ist, die Sache zu beenden. Ich habe einfach nicht die Zeit, das Projekt auf eine Weise zu betreiben, wie ihr sie verdient hättet.

    Ab jetzt werden keine neuen WUs mehr erzeugt. Die verbliebenen Pakete werden an die BOINC-Clients verteilt und die eintreffenden Ergebnisse werden wie gewohnt behandelt. Die BOINC-Statistiken, die regelmäßig von mehreren Webseiten abgerufen werden, werden noch für eine Weile verfügbar bleiben, sodass eure Punkte nicht verloren gehen.

    Danke für euer Verständnis und all eure Unterstützung in den letzten Jahren.

    Mit freundlichen Grüßen,
    Nico

    Zitat Zitat von http://www.distributeddatamining.org/
    The DistributedDataMining project is shutting down!
    Dear ddm users,

    we had a good run during the last years and the computing power which you provided enabled many researchers to achieve there scientific goals.

    Unfortunately, I wasn't able to invest as much time as I wanted into maintaining the ddm project and although the BOINC client was working fine most of the time, the page had more and more problems which were not addressed properly. I was thinking about shuting down the project many times but there was never the right moment.

    Recently, this changed when a critical vulnerability of the Drupal content management system was publicly announced. Since the ddm website was running an old version of Drupal, no fix is available for this issue. As a consequence, I took the website down. There are no indications that the vulnerability was exploited. The actual BOINC server is running on a different machine and would not have been effected anyway.

    I had the choice between (1) updating to the latest Drupal version including the time consuming re-integration of all the BOINC features and (2) shutting down the project for good. I decided that this is the right moment to let it come to an end. I simply do not have the time to operate the project in the way that you would deserve.

    From now on, no new workunits will be generated. The remaining units will be distributed to the BOINC clients and the incomming results will be processed as usuall. The BOINC statistics which are frequently crawled by multiple websites will stay online for a while, so that your credits won't be lost.

    Thank you for your understanding and all your support during the last years.

    Best regards,
    Nico
    von Veröffentlicht: 20.04.2018 23:25
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    Die Anwendungsprobleme, die dazu führten, dass keine neuen Aufgaben verteilt wurden, sind behoben.

    Neue Anwendungsversion
    Die Anwendungsversion 0.18 wurde herausgegeben:
    - einige Speicherlecks sind behoben;
    - einige unnötige Datendateien wurden entfernt;
    - zusätzliche Kompatibilität mit Windows XP wurde hinzugefügt.
    Auch die WU-Erzeugung wurde wieder aktiviert.
    20.04.2018, 7:38:24 MEZ

    Originaltext:
    Zitat Zitat von http://www.acousticsathome.ru/boinc/
    New application version
    Application version 0.18 was released:
    - some memory leaks were fixed;
    - some unnecessary data files were removed;
    - an additional compatibility with Windows XP was added.
    Also, the work generator was enabled again.

    [...]
    20 Apr 2018, 6:38:24 UTC
    von Veröffentlicht: 20.04.2018 23:20
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    Aufgrund von Speicherproblemen legt das Projekt mindestens an diesem Wochenende eine Pause ein:

    Server an diesem Wochenende nicht erreichbar
    Unser Speichersystem (von der Universität verwaltet) hat einige ernste Probleme. Sie arbeiten an der Reparatur, können aber nicht abschätzen, wie lange es nicht funktionieren wird. Wir haben beschlossen, den Server zumindest bis nächsten Montag anzuhalten.
    Danke für euer Verständnis.
    20.04.2018, 19:02:34 MEZ

    Originaltext:
    Zitat Zitat von http://gene.disi.unitn.it/test/
    Server down this weekend
    Our storage system (managed by the University) has some serious problem. They are working to fix it but they cannot estimate for how long it will be down. We decided to stop the server at least until the next Monday.
    Thank you for your understanding.
    20 Apr 2018, 18:02:34 UTC
    von Veröffentlicht: 18.04.2018 23:20
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    Weitere Darstellungen mit RakeSearch gefundener ODLS-Beziehungen wurden der Graphen-Sammlung hinzugefügt, darunter ein wahres Monster mit knapp 650000 Knotenpunkten und in voller Darstellung mehr als 3 Millionen Kanten.

    Der Graph
    Liebe Teilnehmer!

    Wir geben ein paar weitere Arten von Graphen bekannt, die das Projekt RakeSearch gefunden hat.
    Der erste davon - R9_000034562/01 ("m/n" bedeutet, dass dieser Graph vom n-ten Paar orthogonaler diagonaler lateinischer Quadrate in den Ergebnissen der WU m abgeleitet ist) - besteht aus 10 Knoten und 20 Kanten:


    Der nächste - R9_000034858/01 - hat 6 Knoten mit 9 Kanten und sieht aus wie eine Rakete:


    Der dritte - R9_000036897/02 -ist etwas komplizierter, 32 Knoten mit 104 Kanten:

    - aber viele zuvor veröffentlichte Graphen haben ähnliche Eigenschaften.

    Der vierte Graph in diesem Haufen - R9_000037121/02 - hat 28 Knoten mit 88 Kanten und kann in dieser lustigen Form gezeichnet werden:


    Der fünfte Graph - R9_000037218/01 - ist viel größer als die bisherigen Graphen, 210 Knoten mit 1524 Kanten! In einigen Teilen davon sehen wir eine Radialsymmetrie, in einigen Teilen keine Symmetrien:


    Der sechste Graph - R9_000037988/01 - ist der Höhepunkt dieser "Pressemitteilung" und sehr viel größer. Im Moment ist das der größte bekannte Graph aus orthogonalen diagonalen lateinischen Quadraten. Er beinhaltet 649728 Quadrate, die untereinander durch 3178752 orthogonale Beziehungen verbunden sind! Es ist ein wirklich großer Graph! In der untenstehenden Abbildung sind nur 4% dieser Kanten gezeichnet und ihr könnt diese Animation (19 MB!) ansehen, um seine Gewaltigkeit besser zu erfassen.


    Aber wer weiß; welche Wunder erwarten uns im nächsten Haufen Ergebnisse?
    17.04.2018, 19:35:14 MEZ

    Originaltext:
    Zitat Zitat von http://rake.boincfast.ru/rakesearch/
    The Graph.
    Dear participants!

    We announce a few next types of graphs, discovered in RakeSearch project.
    First of them - R9_000034562/01 ("m/n" denote that these graph deduced at n pair of ODLS from result of workunit m) consist of 10 nodes and 20 edges:
    [...]

    Next - R9_000034858/01 - have 6 nodes with 9 edges and looks like a rocket:
    [...]

    Third - R9_000036897/02 - slightly more complicated - 32 nodes with 104 edges:
    [...]
    - but many other previously published graphs have similar properties.

    Fourth graph in this bunch - R9_000037121/02 - 28 nodes with 88 edges, can be draw in some funny form:
    [...]

    Fifth graph - R9_000037218/01 - much larger than previous graphs - 210 nodes with 1524 edges! In some parts of it we see a radial symmetry, in some - no any symmetries:
    [...]

    Sixth graph - R9_000037988/01 - the main "star" of this "press-release" - much more larger. At the moment - the largest of the known graph consisting of ODLS. It includes 649728 squares that connected between themselves by 3178752 relationships of orthogonality! It's a really big graph! On figure below drawn only on 4% of this edges and to better understand its grandiosity you may see this animation (19 Mb!)
    [...]

    But who knows - what wonders wait us in next bunch of results?
    17 Apr 2018, 18:35:14 UTC
    von Veröffentlicht: 18.04.2018 22:50
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    Am kommenden Dienstag, den 24. April, wird SRBase wegen einer geplanten Stromabschaltung nicht erreichbar sein.

    Geplante Stromabschaltung am 24.
    Es werden einige Wartungsarbeiten am lokalen Stromnetz durchgeführt. Ich werde den Server an diesem Tag anhalten. Vielleicht wird der Server später am Abend wieder erreichbar sein.
    18.04.2018, 18:39:52 MEZ

    Originaltext:
    Zitat Zitat von http://srbase.my-firewall.org/sr5/
    planned power outage on 24th
    There are some maintenances on the local electricity. I will stop the server on this day. Maybe later in the evening the server is back online.
    18 Apr 2018, 17:39:52 UTC
    von Veröffentlicht: 18.04.2018 15:30
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    Es gibt erste sichtbare Fortschritte bei der Wiederbelebung des Projektes nach der temporären Stilllegung, erste Tests der neuen Software laufen. Anwendungen gibt es derzeit nur für Windows und es kann alle möglichen Probleme geben.

    Benutzung auf eigene Gefahr
    Ich teste den Validator, die WU-Erzeugung, den Assimilator und die Anwendungen. Es könnte funktionieren oder auch nicht, was bedeutet, dass ihr für eure Arbeit Punkte bekommt oder auch nicht. Es ist noch immer viel zu tun, aber ich mache Fortschritt.
    18.04.2018, 5:53:08 MEZ

    Originaltext:
    Zitat Zitat von https://boinc.thesonntags.com/collatz/
    Use at your own risk
    I'm testing the validator, work generator, assimilator, and applications. It may or may not work which means you may or may not get credit for your work. There is still a lot of work to do but I'm making progress.
    18 Apr 2018, 4:53:08 UTC
    von Veröffentlicht: 17.04.2018 18:25
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    Da es auf einigen Rechnern noch Probleme mit der neuen Anwendung gibt, werden in den nächsten Tagen keine neuen WUs verschickt.

    Erzeugung neuer Aufgaben zeitweise deaktiviert
    Wegen Fehlern auf einigen Rechnern wurde die Erzeugung neuer Aufgaben zeitweise abgeschaltet. Sie wird in ein paar Tagen wieder gestartet, wenn die Anwendung repariert wurde. Bitte entschuldigt die Unannehmlichkeiten und danke für eure Geduld.
    17.04.2018, 7:41:23 MEZ

    Originaltext:
    Zitat Zitat von http://www.acousticsathome.ru/boinc/
    Work generation is temporarily disabled
    Due to some errors which happen on several hosts, work generation was temporarily disabled. It will be relaunched in a few days, after fixing the application. Sorry for the inconvenience, and thank you for your patience.

    [...]
    17 Apr 2018, 6:41:23 UTC
    von Veröffentlicht: 17.04.2018 18:20
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    In letzter Zeit gab es gelegentliche Datenbankprobleme, sodass zeitweise z.B. keine WUs gemeldet werden konnten oder der Versuch, sich auf der Webseite anzumelden, zu Fehlern führte. Die Situation sollte nun etwas besser sein:

    Verbesserte Datenbankstabilität
    Hallo zusammen,

    ich habe einige weitere Einstellungen aktualisiert, um die Stabilität der Datenbank zu verbessern. Wenn ihr Datenbankfehler bemerkt, meldet sie bitte hier.

    Jake
    16.04.2018, 20:21:10 MEZ

    Originaltext:
    Zitat Zitat von http://milkyway.cs.rpi.edu/milkyway/
    Improved Database Stability
    Hey Everyone,

    I made some more configuration updates to improve database stability. If you notice any database errors, please post about them here.

    Jake
    16 Apr 2018, 19:21:10 UTC
    von Veröffentlicht: 16.04.2018 19:50
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    Acoustics@home hat nicht nur ein neues Experiment gestartet, sondern auch die Ergebnisse aus dem letzten Jahr veröffentlicht. Darüber hinaus werden in der Publikation erste Ergebnisse einer GPU-Anwendung beschrieben, sodass man wohl damit rechnen kann, diese auch irgendwann beim Projekt im Einsatz zu sehen.

    Publikation in Open Engineering
    Eine neue Publikation wurde veröffentlicht:
    Oleg Zaikin, Pavel Petrov, Mikhail Posypkin, Vadim Bulavintsev and Ilya Kurochkin. A volunteer computing project for solving geoacoustic inversion problems. In: Open Engineering. 2017. Volume 7, Issue 1. pp. 363-370 (engl.; Ein Volunteer-Computing-Projekt zur Lösung geoakustischer Inversionsprobleme)
    Diese Veröffentlichung beschreibt Acoustics@home und die damit im Jahr 2017 erhaltenen Ergebnisse.
    15.04.2018, 17:11:03 MEZ

    Originaltext:
    Zitat Zitat von http://www.acousticsathome.ru/boinc/
    Paper at Open Engineering
    A new paper was published
    Oleg Zaikin, Pavel Petrov, Mikhail Posypkin, Vadim Bulavintsev and Ilya Kurochkin. A volunteer computing project for solving geoacoustic inversion problems // Open Engineering. 2017. Volume 7, Issue 1. pp. 363-370
    This paper describes Acoustics@home as well as results obtained in it in 2017.
    15 Apr 2018, 16:11:03 UTC
    von Veröffentlicht: 15.04.2018 16:10
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    Das Institute for Protein Design (IPD) an der University of Washington hat vom Open Philanthropy Project 11,3 Millionen Dollar erhalten, um die technologische Revolution des Instituts im Proteindesign zu unterstützen und die Arbeit an der Entwicklung eines universellen Grippeimpfstoffs zu unterstützen.

    Die Zuwendung besteht aus zwei Teilen:

    • 5,6 Millionen Dollar für die Weiterentwicklung von Rosetta, der ursprünglich bei UW entwickelten Softwareplattform für Proteindesign.
    • 5,7 Millionen Dollar für das Programm des Instituts zur Entwicklung eines universellen Grippeimpfstoffs.


    "Wir freuen uns, die Wissenschaft auf eine Art und Weise voranzubringen, die es bisher noch nicht gegeben hat - mit Proteinen, die für das Leben unentbehrlich sind. Diese Zuwendung erkennt an, dass UW Medicine an vorderster Front bei der Erschließung der Schlüssel zur Verwendung von Proteinen in medizinischen Einrichtungen steht", sagt Chris Somerville, Program Officer for Scientific Research am Open Philanthropy Project. "Der universelle Grippeimpfstoff ist eine harte Nuss, aber David Baker hat die Fähigkeit bewiesen, Pionierarbeit für lebensverändernde wissenschaftliche Forschung zu leisten. Es ist aufregend, dass, ob ein universeller Grippeimpfstoff entwickelt wird oder nicht, diese Zuwendung Techniken und Technologien entwickeln wird, die die Wissenschaft voranbringen und eine große Vielfalt von Anwendungsmöglichkeiten in Medizin und Industrie ermöglichen wird".

    Proteine sind die Arbeitspferde aller Lebewesen und erfüllen die Anweisungen der DNA. Vorhandene Proteine sind die Produkte von Milliarden von Jahren Evolution und erfüllen alle wichtigen Funktionen in unserem Körper - sie verdauen Nahrung, bauen Gewebe auf, transportieren Sauerstoff durch die Blutbahn, teilen Zellen, befeuern Neuronen und treiben Muskeln an.

    "Dieses Geschenk beschleunigt eine technologische Revolution in der Entwicklung von Proteinen. Unser Team kann nun Proteine von Grund auf neu entwerfen und völlig neue Moleküle entwickeln, die für neue Therapien, neue Diagnostika und neue Biomaterialien verwendet werden können. Die großzügige Spende des Open Philanthropy Project wird unsere Fähigkeit, Proteine von Grund auf neu zu entwickeln, verändern", sagte David Baker, Direktor des Instituts sowie Professor für Biochemie an der University of Washington School of Medicine und Howard Hughes Medical Institute Investigator. Baker ist Inhaber der Henrietta und Aubrey Davis Stiftungsprofessur für Biochemie.

    Computergestütztes Proteindesign

    Die Zuwendung wird die Bemühungen des Instituts beschleunigen, das Proteindesign auf Computern mit der Rosetta-Software, die ursprünglich in Bakers Labor entwickelt wurde, voranzutreiben. Baker sagte, dass die Zuwendung die Fähigkeit des Instituts, Proteine auf Computern zu entwerfen, sie zu testen, indem es die eigentlichen Proteine im Labor herstellt, und dann den Prozess in einem großen Maßstab zu wiederholen, verändern wird. "Indem wir diesen Zyklus von Design, Bau und Test beschleunigen, werden wir in der Lage sein, die Methoden des Proteindesigns systematisch zu verbessern", sagte Baker.

    Die Ergebnisse und die neue Rosetta-Software werden der wissenschaftlichen Gemeinschaft über die Rosetta Commons zur Verfügung gestellt. The Rosetta Commons ist eine von Baker gegründete Zusammenarbeit mit fast 100 Entwicklern von 23 Universitäten und Labors, die regelmäßig zum Rosetta-Quellcode beitragen und diesen mit anderen teilen, derzeit über 3 Millionen Zeilen.

    Dieses Projekt wird in Zusammenarbeit mit Frank DiMaio, Assistenzprofessor für Biochemie an der University of Washington School of Medicine, durchgeführt.

    Universeller Grippeimpfstoff

    Die derzeitigen Grippeimpfstoffe sollen nur gegen die derzeit zirkulierenden Stämme schützen, so dass die Impfstoffe jedes Jahr neu formuliert werden müssen, da das Virus mutiert, und sind nur teilweise schützend. Mit Unterstützung des Open Philanthropy Project werden Baker und seine Mitarbeiter, Neil King und David Veesler, beide Assistenzprofessoren für Biochemie an der University of Washington School of Medicine, einen Versuch unternehmen, universelle Grippeimpfstoffkandidaten zu entwickeln, die einen dauerhaften Schutz vor mehreren Virusstämmen bieten, einschließlich Stämmen, die das Potenzial haben, Pandemieausbrüche zu verursachen. Die Impfstoffkandidaten basieren auf der von Baker und King entwickelten selbstorganisierenden Protein-Nanopartikel-Technologie. Um sicherzustellen, dass die Impfstoffkandidaten gründlich und effizient getestet werden, werden sie in enger Zusammenarbeit mit den Gruppen von Dr. Barney Graham und Dr. Masaru Kanekiyo am Vaccine Research Center des National Institute of Allergy and Infectious Diseases an den National Institutes of Health arbeiten.

    Ziel ist es, einen Nanopartikel-Impfstoff zu entwickeln, der eine effektive Immunantwort auf viele bestehende und neue Grippestämme auslösen kann. Die Forscher hoffen, dass ein solcher Universalimpfstoff nicht mehr als alle fünf Jahre verabreicht werden muss, um die Notwendigkeit einer jährlichen Grippeimpfung zu beenden.

    Das Institute for Protein Design, das 2012 an der UW Medicine in Seattle gegründet wurde, ist ein Forschungszentrum, das sich auf die Entwicklung maßgeschneiderter Proteine zur Verbesserung der menschlichen Gesundheit und zur Bewältigung der Herausforderungen des 21. Jahrhunderts in Medizin, Energie, Industrie und Technologie konzentriert. Im menschlichen Körper sind Proteine Ketten von Aminosäuren, die von Genen gesteuert werden, um essentielle Lebensfunktionen in jeder Zelle, einschließlich des Gehirns, der Muskeln und der inneren Organe, zu erfüllen. Proteine haben auch Auswirkungen auf das Design neuer Materialien außerhalb des menschlichen Körpers, wie z.B. neuartige Fasern. Das Team des Instituts, bestehend aus 120 Dozenten, Mitarbeitern, Postdoktoranden und Doktoranden, arbeitet an der Entwicklung völlig neuartiger Proteine, um beispielsweise neue, sicherere und wirksamere Impfstoffe und Therapeutika zur Vorbeugung oder Behandlung von Menschen mit schweren Krankheiten zu entwickeln. Das Institut hat einige der weltweit führenden Experten für Proteinwissenschaft, Informatik, Biochemie und biologische Struktur, Pharmakologie, Immunologie und klinische Medizin versammelt.


    Über das Open Philanthropy Project


    Das Open Philanthropy Project identifiziert herausragende Spendenmöglichkeiten, vergibt Zuschüsse und verfolgt und veröffentlicht die Ergebnisse. Hauptförderer sind Cari Tuna und Dustin Moskovitz, Mitbegründer von Facebook und Asana.

    Für den Originaltext siehe diesen Link.

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