• 03.06.2021

    von Veröffentlicht: 03.06.2021 15:15
    1. Kategorien:
    2. Projekte

    Am Ende dieses Monats wird das Subprojekt Microbiome Immunity Project eingestellt, da die Berechnungen mit neuen Methoden auf Basis maschinellen Lernens erheblich effizienter durchgeführt werden können und die Leistung des World Community Grid nicht mehr benötigt wird. Zudem sind für den morgigen Freitag Wartungsarbeiten angekündigt.

    Wichtige Ankündigung zur Zukunft des Microbiome Immunity Project
    Liebe Freiwillige des World Community Grid,

    vielen Dank für eure heldenhaften Beiträge zum Microbiome Immunity Project! Eure Bemühungen haben es uns ermöglicht, die Strukturen von mehr als 330.000 im Mikrobiom enthaltenen Proteinen vorherzusagen, was unser Verständnis der Funktionen dieser unglaublich komplexen Gemeinschaft, die unseren Körper bewohnt und viele Aspekte unserer Gesundheit und Krankheit unterstützt, drastisch verbessert.

    Mit dem jüngsten Aufkommen neuer Proteinfaltungsmethoden, die auf KI und Deep Learning basieren, ist es nun möglich, diese Strukturen hundertmal schneller zu berechnen als zu Beginn des Projekts. Daher schließen wir das Projekt Ende Juni ab und überführen die Ergebnisse in neue, schnellere Techniken, die auf herkömmlichen High-Performance Compute-Clustern durchgeführt werden können und nicht die Leistung des World Community Grid benötigen.

    Euer freiwilliger Einsatz hat die Zugänglichkeit der Strukturbiologie für Mikrobiom-Forscher weltweit verändert und es ermöglicht, diese Techniken in Tausende von Mikrobiom-Projekten einzubinden, die auf Krankheiten von Typ-1 Diabetes und entzündlichen Darmerkrankungen über Krebs bis hin zu neurologischen Erkrankungen abzielen und auf der ganzen Welt durchgeführt werden.

    Wir haben bereits einen wissenschaftlichen Artikel (engl.) veröffentlicht, der aus den Techniken resultiert, die in diesem Projekt entwickelt wurden, und ein zweiter ist auf dem Weg, der diese Protokolle auf die von euch generierten Ergebnisse anwenden wird. Wir werden euch über weitere Ergebnisse auf dem Laufenden halten, sobald wir sie veröffentlichen.

    Nochmals vielen Dank für eure beeindruckenden Beiträge zum MIP!


    Mit besten Grüßen,
    Das Microbiome Immunity Project Team
    01.06.2021 22:04:50 MEZ


    Geplante Wartung am Freitag, 4. Juni

    Zusammenfassung

    Wir aktualisieren das Betriebssystem auf unseren Servern am Freitag, den 4. Juni, ab 16:00 MESZ.
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    Wir werden am Freitag, den 4. Juni, ab 16:00 MESZ eine wichtige Aktualisierung des Betriebssystems auf unseren Servern installieren. Wir gehen davon aus, dass die Arbeiten etwa vier Stunden dauern werden.

    Während dieser Zeit können Teilnehmer zeitweise keine neue Arbeit hoch- oder herunterladen und die Website ist nicht erreichbar.

    Die Freiwilligen müssen keine besonderen Maßnahmen ergreifen, da eure Geräte nach Abschluss der Wartungsarbeiten automatisch erneut versuchen, Verbindung aufzunehmen.

    Wir bedanken uns für eure Geduld und Teilnahme.
    02.06.2021


    Originaltexte:
    Zitat Zitat von https://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread?thread=43484
    Important Announcement about the future of the Microbiome Immunity Project
    Dear World Community Grid volunteers,

    Thank you for your heroic contributions to the Microbiome Immunity Project! Your efforts have allowed us to predict the structures of more than 330,000 proteins contained in the microbiome, dramatically improving our understanding of the functions contained in this incredibly complex community that inhabits all our bodies and underpins many aspects of our health and disease.

    With the recent advent of new protein folding techniques based on AI and deep learning, it is now possible to compute these structures hundreds of times faster than when we started the project. We are therefore drawing the project to a close at the end of June, bridging results to new, faster techniques that can be performed on traditional high-performance compute clusters and do not need the power of World Community Grid.

    What this means is that your volunteer effort has transformed the accessibility of structural biology for microbiome researchers worldwide, allowing these techniques to be incorporated into the thousands of microbiome projects, targeting diseases ranging from type-1 diabetes and inflammatory bowel disease to cancer to neurological disease, and being conducted around the world.

    We already have one scientific article published resulting from the techniques developed from this project, with a second on the way that will apply those protocols to the results that you generated. We will keep you updated on more findings as we publish them.

    Thank you again for your impressive contributions to MIP!


    Best,
    The Microbiome Immunity Project team
    Jun 1, 2021 9:04:50 PM
    Zitat Zitat von https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/viewNewsArticle.do?articleId=706
    Planned Maintenance on Friday, June 4

    Summary

    We are updating the operating system on our servers on Friday, June 4, beginning at 14:00 UTC.
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    We will be applying an important operating system update to our servers on Friday, June 4, beginning at 14:00 UTC. We anticipate that the work will take approximately four hours.

    During some of this time, volunteers will not be able to upload or download new work, and the website will not be accessible.

    Volunteers will not need to take any particular action, as your devices will automatically retry their connections after the maintenance work is completed.

    We appreciate your patience and participation.
    2 Jun 2021
    von Veröffentlicht: 03.06.2021 14:50
    1. Kategorien:
    2. Projekte

    In seiner zweiten Phase nach längerer Pause versucht das Projekt, neue untere Schranken für van-der-Waerden-Zahlen N(r,l) mit r=2 Farben und verschiedenen Längen l zu finden. Im Fall N(2,26) ist das nun gelungen, zudem wurden Abzeichen für verschiedene Stufen in durchschnittlicher und Gesamtpunktzahl eingeführt und die Datenbank durch Löschen alter WUs erheblich verkleinert, wodurch einige Seiten nun erheblich schneller geladen werden.

    Neue untere Schranke, Entfernung alter WUs, Abzeichen
    Wir haben kürzlich eine neue untere Schranke zur Länge 26 mit der Primzahl 2 125 065 391 (~2,1 Milliarden) gefunden, welche beinahe sicher der bestmögliche Wert ist, da wir ein weiteres Intervall von 350 Millionen überprüft haben und eine einfache Heuristik eine Wahrscheinlichkeit von nur 5% vorhersagt, dass wir noch einen besseren Wert finden können. Diese Schranke ist etwas unterhalb der vorhergesagten Asymptote, was für Schranken zu geraden Längen normal ist.


    Es gibt auch zwei neue Abzeichen für verschiedene Level in der durchschnittlichen Punktzahl (RAC) und Gesamtpunktzahl (freundlicherweise von Pavel_Kirpichenko erstellt). Die Gesamtpunktzahl-Abzeichen sind die mit den schwarzen Rechtecken, die RAC-Abzeichen sind die darum herum. Das zugehörige Level wird beim Zeigen mit der Maus auf das Abzeichen angezeigt (z.B. erscheint T1M unter einem Abzeichen mit Rechteck und entspricht einer Gesamtpunktzahl von 1 Million).

    Wir haben auch damit begonnen, alte WUs zu entfernen. Die Zahl der Aufgaben in der Datenbank wurde von 4 Millionen auf knapp mehr als 100 000 reduziert. Die Aufgabenlisten laden nun beinahe sofort.
    02.06.2021, 23:03:18 MEZ

    Originaltext:
    Zitat Zitat von http://www.vdwnumbers.org/forum_thread.php?id=86
    New Bound, Task Purging, Badges
    We have recently found a new bound for length 26 with prime 2,125,065,391 (2.1 billion), which is almost certainly optimal given that we have checked another interval of 350 million and a simple heuristic predicts a probability of 5% that we can do better. This bound is slightly below the predicted asymptote, which is common for even-length bounds.


    There are also two new badges for tiers of recent average credit (RAC) and total credit (courtesy of Pavel_Kirpichenko). The total credit badges are those with the black rectangles and the RAC badges are those around. Hovering over the badge with your mouse will show its tier (e.g., T1M appears under a badge with a rectangle and corresponds to 1 million total credit).

    We've also begun purging old tasks. The number of task records has been reduced from 4 million to just over 100 thousand. Task lists now load almost immediately.
    2 Jun 2021, 22:03:18 UTC
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