Seit einigen Tagen kann in den Projekteinstellungen zwischen langen (long tasks) und kurzen WUs (short tasks) gewählt werden. Die kurzen WUs richten sich explizit an langsamere Einplatinenrechner und sind daher ausschließlich für Linux auf ARM-CPUs verfügbar.

СmDock-Anwendungen für lange und kurze WUs
Liebe Teilnehmer!

Wir haben neue Anwendungen namens CurieMarieDock 0.2.0 long tasks und CurieMarieDock 0.2.0 short tasks erstellt, die beide auf der CmDock-Version 0.2.0 (engl.) basieren. Der Algorithmus beider Anwendungen ist identisch, aber für short tasks haben wir nur die ARM-Version erstellt und planen spezielle, fünfmal kleinere WUs zu erzeugen, welche einen Teil des gesamten Aufgabensatzes abdecken. Wir empfehlen allen Besitzern von kleinen Einplatinenrechnern wie Raspberry Pi, diese short tasks-Anwendung auszuwählen.

In den nächsten ein, zwei Tagen werden wir weiterhin neue Sprot_delta_v1-WUs (erweiterter Durchlauf) für beide Anwendungen erzeugen, aber später werden wir eine Stichprobe von Aufgaben für ein neues Bindungsziel (#22) verteilen und diese nur als long tasks, weil alle Aufgaben dieser Stichprobe groß sein werden. Gleichzeitig wird das Projekt weiterhin Sprot_delta_v1-WUs als short tasks verschicken. Und dann werden wir weiter lange und kurze WUs für die jeweiligen Anwendungen verschicken.

Wir hoffen, dass diese Erklärung die Situation klarstellt.

Danke für eure Teilnahme und CPU-Zeit-Spenden!
14.01.2023, 00:35:04 MEZ


Zum genannten Bindungsziel #22 gibt es inzwischen genauere Informationen. Es geht um ein Enzym, das vor zwei Jahren schon einmal behandelt wurde.

Bindungsziel #22: corona_RdRp_v2
Liebe Teilnehmer,

nach ersten Untersuchungen des anerkannten SARS-CoV-2-Ziels RNA-abhängige RNA-Polymerase (engl. RNA-dependent RNA polymerase, RdRp) verlassen wir die Protease-Untersuchungen und konzentrieren uns auf RdRp zusammen mit weiteren Nichtstrukturproteinen (NSP). RdRp (NSP12) ist nämlich für die Transkription der Gene des Virus und letztlich die Reproduktion des Virusgenoms verantwortlich. Die untersuchte Stelle bindet RNA und wurde zuvor im Zusammenhang mit Remdesivir, Galidesivir, Molnupiravir und einigen anderen kleinen Molekülen untersucht. Weiterführende Literatur:

• Structure of replicating SARS-CoV-2 polymerase (engl., Struktur der replizierenden SARS-CoV-2-Polymerase)
• Identification of novel SARS-CoV-2 RNA dependent RNA polymerase (RdRp) inhibitors: From in silico screening to experimentally validated inhibitory activity (engl., Identifizierung neuer Hemmstoffe für SARS-CoV-2-RdRp: Vom In-Silico-Screening zur experimentell bestätigten Hemmaktivität)
• RNA dependent RNA polymerase (RdRp) as a drug target for SARS-CoV2 (engl., RdRp als Angriffspunkt für SARS-CoV-2-Medikamente)
• Ribavirin, Remdesivir, Sofosbuvir, Galidesivir, and Tenofovir against SARS-CoV-2 RNA dependent RNA polymerase (RdRp): A molecular docking study (engl., Ribavirin, Remdesivir, Sofosbuvir, Galidesivir und Tenofovir gegen SARS-CoV-2-RdRp: Eine molekulare Docking-Studie)

Abbildung 1: RdRp (weiß) zusammen mit einer RNA-Kette und N⁴-Hydroxycytidin von Molnupiravir in der aktiven Bindungsstelle (rotes Stäbchenmodell).

Mit besten Grüßen,
Natalia, Marko, Črtomir, hoarfrost
15.01.2023, 18:45:23 MEZ


Originaltexte:

Die 67-stellige Primzahl 7 118 712 195 058 078 015 963 765 386 322 444 134  285 243 628 705 404 423 063 643 507 397 (in Worten: sieben Undezillionen einhundertachtzehn Dezilliarden siebenhundertzwölf Dezillionen ... sechshundertdreiundvierzig Millionen fünfhundertsiebentausend-dreihundertsiebenundneunzig) wurde kürzlich als zweitgrößter bekannter Primfaktor der 669-stelligen Cunningham-Zahl 2²²²²+1 identifiziert.

P67 mit ECM gefunden
Simone Bonzanini hat einen 67-stelligen Primfaktor der Cunningham-Zahl 2²²²²+1 gefunden. Das spart eine Menge NFS-Arbeit. Die gefundene Primzahl ist die erste in Paul Zimmermanns ECMNET-Rekordliste für dieses Jahr.
09.01.2023

Originaltext:

Wie angekündigt verteilt das Projekt nach mehrmonatiger Pause nun wieder WUs. Zunächst läuft ein neuer Beta-Test:

Neue Simulationen
Liebe Freiwillige,
wie in den vorherigen Meldungen angegeben, mussten wir das Anpassen des Modells anhalten, weil es ein Experiment gab, an das wir es nicht gut anpassen konnten. Nach Auswertung unserer Ergebnisse glauben wir, dass ein limitierender Faktor die Anzahl der Simulationen sein könnte, die wir zum Anpassen des Verhaltens des Modells an das Experiment ausführen. Deshalb werden wir einen neuen Test durchführen, bevor wir mit der Anpassung des Modells fortfahren, um das genauer zu untersuchen. Wir haben gerade neue Simulationen gestartet, die uns bei der Auswertung dieses Experiments helfen, um zu sehen, ob wir das Modell und seine Anpassung verbessern können.

Danke für eure Geduld während dieser Pause. Wir hoffen, nach Auswertung der Ergebnisse dieses Experiments mit den Simulationen fortfahren zu können.

Grüße,
Jesús
17.01.2023, 11:56:05 MEZ

Originaltext:

Nachgereicht sei der Rückblick auf das vorige Jahr bei unserem aktuellen Teamwork-Projekt. Im laufenden Jahr wird das Projekt neben den Probedivisionen (engl. Trial Factoring, TF) auf Grafikkarten wie gewohnt mit CPU-Leistung am Erreichen einiger Ziele von Conjectures 'R Us (CRUS, engl.) mitwirken.

SRBase - Rückblick auf 8 Jahre
Das Projekt hat sein achtes Jahr überstanden.

Im Vergleich zu den letzten Jahren wurde folgender Fortschritt gemacht:

2014-2015 - 1 Basis gelöst, 314 Basen noch nicht begonnen
2015-2016 - 5 Basen gelöst, 297 Basen noch nicht begonnen
2016-2017 - 5 Basen gelöst, 282 Basen noch nicht begonnen
2017-2018 - 1 Basis gelöst, 264 Basen noch nicht begonnen
2018-2019 - 6 Basen gelöst, 218 Basen noch nicht begonnen
2019-2020 - 4 Basen gelöst, 120 Basen noch nicht begonnen
2020-2021 - 3 Basen gelöst, 101 Basen noch nicht begonnen
2021-2022 - 0 Basen gelöst, 97 Basen noch nicht begonnen
insgesamt - 25 Basen gelöst, 97 Basen noch nicht begonnen

Das war das schlimmste Jahr überhaupt. Defekte Hardwarekomponenten, Krieg und auch eine hohe Inflation nach Corona, welche die Kosten beeinflusst.

Die LLR-Anwendung wurde durch LLR2 ersetzt, was weniger Arbeit und keine unnötigen Doublechecks bedeutet, aber mit weniger Leistung. Intel-ARC-GPUs werden nun unterstützt, CUDA-12-Anwendungen für die NVIDIA RTX-4000-Serie sind in Arbeit.

Das Projekt hat das 73-74-Bit-Level bei TF nahezu abgeschlossen, es läuft nun 74-75-Bit, was wesentlich mehr Zeit benötigt.
Die neuen CRUS-Ziele für 2023 sind verfügbar und einige wurden schon eingerichtet.

Ich wünsche euch allen ein gesundes neues Jahr 2023 und natürlich gesunde Hardware!
31.12.2022, 12:11:22 MEZ

Orignaltext: