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Thema: RNA World

  1. Avatar von newman
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    #226

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    Hallo Beorn,

    Das war mir auch gerade aufgefallen, als ich deinen Liks gefolgt bin. vielen Dank! Werde die mal abbrechen. Steht auch schon ne Weile bei 95. eppes.

  2. Avatar von Beorn
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    #227

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    Hallo newman,

    mein Vorschlag wäre BOINC zu stoppen und die stderr.txt zu löschen bzw. mit einer leeren Textdatei zu überschreiben. Außerdem zu prüfen, ob mehr als 2 GB Festplatte für BOINC noch frei sind.

    Wenn Du abbrichst, ist das Arbeitspaket vermutlich futsch. Ist halt blöd für pepita von den Nordlichtern, der offensichtlich schon seit September daran kaut.

    EDIT: Das die Wutze bei 98,765% oder so hängen bleibt, scheint bei den längeren Wutzen normal zu sein. (?)

    EDIT #2: OK, schon passiert. Komischerweise wurde noch eine Kopie rausgeschickt und die hat Dr. Michael H.W. Weber (Projektleiter) persönlich bekommen.

    EDIT #3: Ich glaube mal gelesen zu haben, dass BOINC nur gleiche / ähnliche Fehler zusammenzählt, also vllt. zählt deshalb Abbruch durch Benutzer nicht als 10ter Fehler?

    Gruß
    Geändert von Beorn (13.10.2013 um 22:42 Uhr)

  3. Avatar von newman
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    #228

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    Naja, aber bevor es mir so geht wie dir wo die WU nach 196,891.63 sec den Abflug gemacht hat, brech ich sie bei 8 anderen Fehlern doch lieber ab auch wenn auf meiner boinc Partition noch 660 Gb frei gewesen wären

  4. Avatar von Beorn
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    #229

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    Zitat Zitat von newman Beitrag anzeigen
    wo die WU nach 196,891.63 sec den Abflug gemacht hat
    Dafür zieh ich die andere noch verbleibende Wutze jetzt auch mit der Hand auf.




    Hinzugefügter Post:

    Zitat Zitat von Beorn Beitrag anzeigen
    Komischerweise wurde noch eine Kopie rausgeschickt und die hat Dr. Michael H.W. Weber (Projektleiter) persönlich bekommen.
    Half auch nix, jetzt ist das Paket im Eimer: Zu viele Fehler (evtl. ein Bug).

    Ist das eigentlich normal, dass Beiträge im Rechenkraft.net / RNA World Forum auch nach über 12h nicht freigegeben werden?
    Geändert von Beorn (14.10.2013 um 09:35 Uhr) Grund: Antwort auf eigenen Beitrag innerhalb von 24 Stunden!


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    #230

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    Ist das eigentlich normal, dass Beiträge im Rechenkraft.net / RNA World Forum auch nach über 12h nicht freigegeben werden?
    Soweit ich weiß muss nur der erste Post per Hand freigeschaltet werden, damit Spambots nicht das Forum zuspammen. Alles ab dem 2. Post ist automatisch freigeschaltet.
    12 Stunden kann das schon mal dauern. Muss halt erst einer der Admins online kommen. Die sind ja auch nicht rund um die Uhr im Forum unterwegs.

  6. Avatar von Beorn
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    #231

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    Danke, Dunuin. Da der Beitrag noch nicht freigeschaltet wurde (und mittlerweile auch leicht veraltet wirken dürfte ), will ich hier nochmal kurz berichten:

    1. Nachdem die WU zu Paket 6330530 nach knapp 55 Std. mit Fehler "Maximum disk usage exceeded" abgebrochen war, schaute ich mir die verbleibende WU zu Paket 6330532 nochmal genauer an. Die stderr.txt im BOINC slot (\ProgramData\BOINC\slots\xx) hatte nach rund 61 Std. Rechenzeit eine Größe von 420 MB erreicht.

    2. Der Wert <rsc_disk_bound> für die WU war serverseitig auf 2 GB gesetzt: <rsc_disk_bound>2000000000.000000</rsc_disk_bound>

    3. Zusammen mit der virtuellen Festplatte und dem Checkpoint sowie den anderen, kleineren Dateien im BOINC slot war durch die aufgeblähte stderr.txt dieses Limit beinahe erreicht.

    4. Ich habe daher BOINC gestoppt, gewartet bis die VM Prozesse beendet sind und habe dann in der client_state.xml (\ProgramData\BOINC\) den Wert <rsc_disk_bound> manuell auf 25 GB erhöht. (Hinweis: Der BOINC Manager muß natürlich auch diesen freien Platz auf der Festplatte zur Verfügung haben!) Außerdem habe ich den Inhalt der stderr.txt gelöscht (da sich die Datei mit Windows-Bordmitteln nicht mehr öffnen ließ, der Einfachheit halber leere Datei drüberkopiert).

    5. Nach einem Neustart um 18:43 Uhr gestern vom gespeicherten Snapshot aus, wuchs die stderr.txt zunächst nur in 'normalem' Umfang an. Heute nachmittag jedoch, um 14:41 Uhr, also nach weiteren rund 20 Std., trat ein Fehler auf und danach stieg die Größe der stderr.txt wieder exzessiv an, bis jetzt auf immerhin rund 30 MB. Der Fehler scheint mit den Logdateien im Verzeichnis \ProgramData\BOINC\slots\xx\boinc_fbxxxxxxxxx\Logs \ zusammenzuhängen. Siehe Auszug aus der 30 MB großen stderr.txt anbei. Als Folge wird der Inhalt der Logdateien offensichtlich wieder und wieder in stderr.txt geschrieben, wodurch die Datei schnell anwächst.

    Schlußfolgerung: Entweder muss serverseitig der <rsc_disk_bound> Wert erhöht oder die Art und Weise wie die stderr.txt geschrieben wird bei den betroffenen Paketen geändert werden.

    Ich fürchte daher, selbst wenn ich diese WU durchbringe, wird das Paket insgesamt auch im Eimer landen.

    Gruß

    Code:
    
    ##13 Oct 2013, 14:18:00 UTC: content of stderr.txt deleted, after file size had increased to 431.093.967 bytes
    2013-10-13 18:43:12 (3048): vboxwrapper: starting
    2013-10-13 18:43:12 (3048): Feature: Enabling trickle-ups (Interval: 1209600.000000)
    2013-10-13 18:43:12 (3048): Detected: VirtualBox 4.2.16r86992
    2013-10-13 18:43:13 (3048): Restore from previously saved snapshot.
    2013-10-13 18:43:14 (3048): Restore completed.
    2013-10-13 18:43:14 (3048): Starting VM.
    2013-10-13 18:43:18 (3048): Successfully started VM.
    2013-10-13 18:43:18 (3048): Setting cpu throttle for VM. (100%)
    2013-10-13 18:53:23 (3048): Status Report: Job Duration: '0.000000', Elapsed Time: '220442.039090', Network Bytes Sent (Total): '0.000000', Network Bytes Received (Total): '0.000000'
    2013-10-13 18:53:23 (3048): Creating new snapshot for VM.
    2013-10-13 18:53:30 (3048): Deleting stale snapshot.
    2013-10-13 18:53:32 (3048): Checkpoint completed.
    
    (...)
    
    2013-10-14 14:25:31 (2364): Creating new snapshot for VM.
    2013-10-14 14:25:38 (2364): Deleting stale snapshot.
    2013-10-14 14:25:40 (2364): Checkpoint completed.
    2013-10-14 14:36:57 (2364): Creating new snapshot for VM.
    2013-10-14 14:37:03 (2364): Deleting stale snapshot.
    2013-10-14 14:37:05 (2364): Checkpoint completed.
    2013-10-14 14:41:54 (2364): Error in get vm log for VM: 3
    Arguments:
    showvminfo "boinc_fb76a72fc6655131" --log 0 
    Output:
    VirtualBox VM 4.2.16 r86992 win.amd64 (Jul  4 2013 15:51:44) release log
    00:00:00.040636 Log opened 2013-10-13T21:58:37.073124100Z
    00:00:00.040643 OS Product: Windows 7
    00:00:00.040646 OS Release: 6.1.7601
    00:00:00.040647 OS Service Pack: 1
    00:00:00.078812 DMI Product Name: P15xEMx
    00:00:00.081623 DMI Product Version: Not Applicable                    
    00:00:00.081631 Host RAM: 16280MB total, 13970MB available
    00:00:00.081633 Executable: C:\Program Files\Oracle\VirtualBox\VBoxHeadless.exe
    00:00:00.081634 Process ID: 1876
    00:00:00.081635 Package type: WINDOWS_64BITS_GENERIC
    00:00:00.086447 Installed Extension Packs:
    00:00:00.086480   Oracle VM VirtualBox Extension Pack (Version: 4.2.16 r86992; VRDE Module: VBoxVRDP)
    
    (...)
    


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    #232

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    Da hast du noch eine alte WU. Die neueren WUs wurden meine ich auf 4GB erhöht.
    Hatten erst mit 2GB gerechnet aber vergessen, dass da beim Snapshot erstellen sich kurzzeitig die Dateigröße verdoppelt.

    Irgendwie so war das glaube ich.

  8. Avatar von Beorn
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    #233

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    Ok, verstehe. Bei einem Größenzuwachs der stderr.txt von z. Zt. ca. 10 MB pro Stunde wären jedoch auch 4 GB nach rund 11 Tagen erschöpft. Die geschätzte Laufzeit auf dem Referenzsystem liegt für das Paket 6330532 bei über 12 Wochen.

    EDIT: Paket 6330530 wurde wieder zum Leben erweckt, durch Erhöhung der max Fehler und Gesamt Werte. Außerdem wurde mein Beitrag im Forum heute abend freigeschaltet. Danke.
    Geändert von Beorn (14.10.2013 um 22:18 Uhr) Grund: Update

  9. Avatar von Beorn
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    #234

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    Es gibt neue cmsearch VM (VirtualBox) 1.0.2 WU! Wer also bei der RNA Lotterie mitspielen möchte, mag zugreifen.

  10. Avatar von Saenger
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    #235

    Standard

    Zitat Zitat von Beorn Beitrag anzeigen
    Es gibt neue cmsearch VM (VirtualBox) 1.0.2 WU! Wer also bei der RNA Lotterie mitspielen möchte, mag zugreifen.
    Na ja, die für die VM haben immerhin jetzt Checkpoints, ausschalten o.ä.geht also. Es kann aber insgesamt genau so lange dauern wie bislang, um sie komplett abzuliefern

  11. Avatar von Treti
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    #236

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    für Windows wohl nicht. 135 Stunden Laufzeit (I7 2600k) ohne Checkpoints - das tue ich mir nicht nochmal an.

    Nachdem ich gestern den Rechner neu starten mußte, waren ich glaube 2 Tage Arbeit weg und die WU hat wieder bei Null angefangen.
    "Grenzen? Ich habe noch nie eine gesehen, aber ich habe gehört, daß sie in den Köpfen einiger Leute existieren." - Thor Heyerdahl

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  12. Avatar von Saenger
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    #237

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    Zitat Zitat von Treti Beitrag anzeigen
    für Windows wohl nicht.
    Doch, auch für Fenster, allerdings generell nur 64bit.
    Du musst nur a) VirtualBox installiert haben und b) die entsprechende App auch in Deinen Kontoeinstellungen angewählt haben.

  13. Avatar von Beorn
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    #238

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    Zitat Zitat von Saenger Beitrag anzeigen
    Du musst nur a) VirtualBox installiert haben und b) (...)
    VirtualBox 4.2.16, wenn ich das ergänzen darf. Die aktuelleren Versionen machen Probleme. Siehe auch Newseintrag vom 20.10.: http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=109

  14. Avatar von Treti
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    #239

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    Zitat Zitat von Saenger Beitrag anzeigen
    Na ja, die für die VM haben immerhin jetzt Checkpoints, ausschalten o.ä.geht also. Es kann aber insgesamt genau so lange dauern wie bislang, um sie komplett abzuliefern
    Hier hast du dich auf die VM (Virtuelle Maschine) bezogen, unter die ich Virtual Box einordne. Ich habe mich auf rein Windows bezogen. Bei mir Win 7 64bit

    Und ja, es sind alle Anwendungen von RNA erlaubt. Was man bekommt ist eine andere Frage.

    Nein, Virtual Box habe ich nicht, ich löse das Dilemma für mich mit oben erwähnter Variante.
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  15. Avatar von modesti
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    #240

    Standard



    Ich bitte einmal um Verlängerung für diese WU: http://www.rnaworld.de/rnaworld/resu...ultid=14920620
    Nach einem Stromausfall letztes WE startete sie von vorn (normal). Bei geschätzten 10 Wochen Laufzeit auf dem Referenzsystem kann die daher nicht bis 29.11. fertig werden
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  16. Avatar von Beorn
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    #241

    Standard

    Wie passend: lat. Gallus - der Hahn, aber halt auch der Gallier.

  17. Avatar von Treti
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    #242

    Standard

    hätte jetzt noch ca. 5 Stunden gehabt, dann wäre die WU durch. Da meldet sich die Kiste mit Bluescreen ab und die WU fängt nach Neustart lustig von vorn an.

    165 Stunden zzgl der oben erwähnten Zeit für die Katz. RNA fliegt vom Rechner. Zumutung.

    Wer nicht mehr wollte, ob WIN 7 oder VMWare mit XP weiß ich nicht, ist auch egal.
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  18. Avatar von modesti
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    #243

    Reden

    Zitat Zitat von Beorn Beitrag anzeigen
    Wie passend: lat. Gallus - der Hahn, aber halt auch der Gallier.
    Ja, mein Hähnchen/Hühnchen braucht noch 'ne Weile, bis es flügge ist
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  19. Avatar von Beorn
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    #244

    Ausrufezeichen Workunit erfolgreich beendet!

    Hurra! Heute wurde meine erste Workunit aus der cmsearch VM Batch vom 20. Oktober erfolgreich beendet und hochgeladen!

    http://www.rnaworld.de/rnaworld/resu...ultid=14920843

    EDIT 09.11.: Mittlerweile hat auch mein Flügelmann beendet und es gab Credits.
    Geändert von Beorn (09.11.2013 um 01:27 Uhr)

  20. Avatar von Beorn
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    #245

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    Und heute eine andere VM Wutze nach Neustart durch den bekannten "already locked by a session"-Fehler verloren. Momentan muss man die Wutzen echt wie rohe Eier behandeln.

    http://www.rnaworld.de/rnaworld/resu...ultid=14920783

  21. Avatar von MichaelR
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    #246

    Standard WU verlängern

    wen yoyo oder Michael H.W. Weber hier mitlesen, ich hätte da bitte eine Wu um ca 3 Monate zu verlängern : Paket 6330886
    Gruß Michl

    Die Antwort ist 42. Die Frage muss noch formuliert werden

  22. Avatar von JayPi
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    #247

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    Das finde ich schon interessant:

    Heute habe ich für 5 WUs vom November 2012, die ich aufgrund langer Laufzeiten abgebrochen hatte, insgesamt 1264 Credits noch erhalten.

  23. Avatar von [SG-2W]Kurzer
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    #248

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    Die WU ist nun nach 304 Tagen (oder 7298 Std) fertig
    - mit Fehler! Konnte wohl irgendwas nicht mehr laden.

    Gruß Kurzer

  24. Avatar von totoshi
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    #249

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    Ich habe die Nacht mal eine WU bekommen. Allerdings sind nach rund 7 Stunden erst 0,189% geschafft und die geschätzte verbleibende Laufzeit liegt bei ~128 Tagen. Deadline ist allerdings schon der 29.01.2018.
    Hattet Ihr sowas auch schon? Was macht man dann am Besten? Bescheid sagen, so dass die Deadline angepasst wird?
    LG Torsten


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    #250

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    Die WU kommuniziert mit dem Server und wird automatisch verlängert, wird aber nicht im Boinc aktualisiert, nachzusehen in den Eigenen WU-Anzeigen bei RNA
    hier "pilotpirx" in projekten "cpuid"

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