WCG: Mapping Cancer Markers

[Dennis-TW]

Nach dem ersten Tag liegt SG auf Platz 11

Ich bin dann jetzt erstmal bis Mittwoch unterwegs, Rechner laufen aber weiter für WCG und MCM.

[Flaeminger]

Boah, das ist ja mal ein richtig spannender Wettkampf, bin mit 8 Kernen bis zum Ende dabei.

[XSmeagolX]

Ich habe auch mal den Haken bei MCM dazugenommen.

[Dennis-TW]

SG mittlerweile auf Platz 10, Platz 9 könnte man sich vielleicht als Ziel setzen.

[SETIBOOSTER]

13 Kerne dabei.

[Dennis-TW]

2 Tage vor dem Ende hat SG den angestrebten 9. Platz erreicht, kann sich aber längst noch nicht sicher sein, diesen bis zum Schluss zu halten.

Die beste Empfehlung ist bis zum Ende voll drauf zu bleiben

[XSmeagolX]

Ich lasse dann meine 20 Threads auch über das WE auf MCM weiterlaufen.

[Dennis-TW]

SG hat die Kill The Cancer Challenge 2020 auf dem 9. Platz abgeschlossen.

Danke an alle Teilnehmer

Hier sind die ersten 10 (von insgesamt 67) Teams:

[lugu]

Das war doch mal ein schöner Zwischenspurt. Hat Spaß gemacht!

[fufu]

Nächstes Update:

Wir hatten heute unsere monatlichen Telefonkonferenz.

1. Sarkom-Einheiten - Das Technik Team von WCG und die Forscher haben einige Punkte besprochen (z.B. die Laufzeit jeder Arbeitseinheit), die geklärt werden müssen, bevor die Forscher uns Produktionseinheiten schicken. Wir werden eine Ankündigung machen, sobald die Umstellung von Eierstockkrebs auf Sarkom offiziell ist.
2. Betatest der Android-Arbeitseinheiten - Die bisher gelaufenen Batches sehen gut aus. Die durchschnittliche CPU-Zeit betrug ~12-13 Stunden. Wir gehen davon aus, dass die Android-Arbeitseinheiten bald in die reguläre Produktion überführt werden, und wir werden eine Ankündigung machen, wenn wir dies tun.

Status der Arbeitseinheiten:

Zum Download verfügbar: 273 Batches
In Bearbeitung: 1.094 Batches (9.432.542 Arbeitseinheiten)
Abgeschlossen: 58.312 Batches - 1.187 Batches in den letzten 30 Tagen - durchschnittlich 39,6 Batches pro Tag
Geschätzter Rückstand: 6,9 Tage

[Dennis-TW]

Hier die deutsche Übersetzung des März-Updates für MCM:

Hier sind die Details unseres Gesprächs mit den Forschern vom März.

1. Wir haben gestern Sarkom-Einheiten (für Computer und Android) gestartet. Das technische Team und die Forscher diskutierten die sehr frühen Daten über die Laufzeiten und mögliche kleine Änderungen an den Arbeitseinheiten, die den Sarkomforschern helfen werden, sich auf bestimmte wissenschaftliche Fragen zu konzentrieren.

2. Wir haben einen ausreichenden Vorrat an Arbeitseinheiten, und die Forscher haben einen stabilen Prozess auf ihrer Seite, um die Arbeit am Laufen zu halten. Es gibt derzeit keine Schätzung, wie lange die Sarkom-Einheiten bei WCG berechnet werden.

3. Jetzt, wo fast alle Arbeitseinheiten für Eierstockkrebs wieder bei den Forschern sind, bereiten sie sich darauf vor, die Daten mit ähnlichen Techniken wie beim Lungenkrebs zu analysieren. Sie arbeiten auch noch an der Analyse von Lungenkrebsdaten.

4. Der Forschungsleiter warb für das Projekt bei einem kürzlich in Vancouver abgehaltenen Treffen, bei dem es um Big Data und die Veränderung der klinischen Praxis ging. Er sollte zu einem ähnlichen Treffen nach Boston reisen, aber er wird jetzt virtuell teilnehmen. (Dies geschieht in letzter Zeit bei vielen Forschern, da Konferenzen aufgrund von COVID-19 abgesagt werden oder ausschließlich virtuell stattfinden).

Status der Arbeitseinheiten:

Zum Herunterladen verfügbar: 720 Batches
In Bearbeitung: 1.030 Batches (8.482.542 Arbeitseinheiten)
Abgeschlossen: 59.479 Batches - 1.238 Batches in den letzten 30 Tagen - durchschnittlich 41,3 Batches pro Tag
Geschätzter Arbeitspuffer: 17,4 Tage

Link zum Original

[Dennis-TW]

Hier die deutsche Übersetzung des April-Updates für MCM:

Wir haben gerade unser monatliches Gespräch mit den Forschern abgeschlossen.

1. Der Großteil ihrer Arbeit wird zu Hause erledigt, da ihre Labors auf dem Campus zumindest bis Anfang Mai geschlossen sind. Solange ihre Server in Betrieb bleiben, werden sie weiterhin Arbeitseinheiten erstellen, senden und empfangen.

2. Unser derzeitiger Arbeitsvorrat beträgt etwa 16 Tage.

3. Die Forscher schlagen vor, einige kleinere Code-Änderungen an den Arbeitseinheiten vorzunehmen, die ihnen bei der Beantwortung spezifischer Forschungsfragen helfen werden. Diese Änderungen werden weder frühere noch aktuelle Arbeitseinheiten ungültig machen. Weitere Informationen dazu werden wir bei der nächsten monatlichen Aktualisierung erhalten.

4. Die Konferenzen, deren Teilnahme für dieses Frühjahr und den Sommer geplant war, werden meist um sechs Monate oder länger verschoben, da die Planer auf die Sicherheit großer Versammlungen und Reisen achten.

Zum Download verfügbar: 706 Batches
In Bearbeitung: 1.290 Batches (11.392.542 Arbeitseinheiten)
Abgeschlossen: 60.666 Batches - 1.300 in den letzten 30 Tagen - durchschnittlich 43,3 pro Tag
Geschätzter Vorrat: 16,3 Tage

[Dennis-TW]

Hier die deutsche Übersetzung des Mai-Updates für MCM:

Wir haben gerade unser monatliches Gespräch mit den Forschern abgeschlossen.

1. Die Arbeitseinheiten scheinen insgesamt reibungslos zu laufen, einschließlich der meisten Android-Einheiten.

2. Sie arbeiten weiter an der Konsolidierung der Daten aus den Arbeitseinheiten für Eierstockkrebs.

3. Sie haben damit begonnen, 33 Studien zu Lungenkrebs-Markern zu untersuchen, um festzustellen, wie die Daten aus diesen Studien im Vergleich zu den Daten stehen, die sie aus der Arbeit am World Community Grid erhalten haben. Diese Analyse befindet sich noch in einem sehr frühen Stadium.

4. Hinsichtlich der vorgeschlagenen geringfügigen Code-Änderung, die im Bericht vom letzten Monat erwähnt wurde, wird das technische Team von WCG bald (nach dem Start von OpenPandemics) einen Blick auf den Code werfen.

5. Das Forschungsteam, das nicht direkt mit der Kartierung von Krebsmarkern zu tun hat, setzt einige seiner Werkzeuge ein, um einem internationalen Konsortium von Institutionen zu helfen, das an der Analyse von SARS-CoVD2 arbeitet.

Aktueller Status der Arbeitseinheiten:

Zum Herunterladen verfügbar: 862 Batches
In Bearbeitung: 1.279 Batches (11.182.542 Arbeitseinheiten)
Abgeschlossen: 62.351 Batches - 1.373 Batches in den letzten 30 Tagen - durchschnittlich 45,8 Batches pro Tag
Geschätzter Vorrat: 18 Tage

[Dennis-TW]

Hier die deutsche Übersetzung des Juni-Updates für MCM:

Wir haben gerade unser monatliches Gespräch mit den Forschern beendet.

1. In Bezug auf kleinere Code-Änderungen, die in den letzten paar Monatsberichten erwähnt wurden, wird das technische Team der WCG eine Ankündigung machen, sobald diese Änderungen für Beta-Tests durch Freiwillige bereit sind. (Keine genaue Zeitvorgabe, aber wir gehen davon aus, dass dies bald der Fall sein wird, wenn die Alpha-Tests gut verlaufen).

2. Nicht direkt mit Mapping Cancer Markers verbunden - aber im Anschluss an ihre Arbeit mit einem internationalen Konsortium von Institutionen, das an der Analyse von SARS-CoVD2 arbeitet, haben sie einen Zuschuss beantragt, um Arbeiten über Proteininteraktionen innerhalb des Virus durchzuführen. Es gibt allerdings keine Zeitvorgabe, wann sie wieder davon hören werden.

3. Keine größeren Aktualisierungen der laufenden Analysen der Daten zu Lungenkrebs und Eierstockkrebs.

Zum Herunterladen verfügbar: 828 Batches
In Bearbeitung: 904 Batches (7.252.542 Arbeitseinheiten)
Abgeschlossen: 63.407 Batches - 1.139 Batches in den letzten 30 Tagen - durchschnittlich 38 Batches pro Tag
Geschätzter Vorrat: 21 Tage

[Dennis-TW]

Hier die deutsche Übersetzung des Juli-Updates für MCM:

Wir haben gerade unser monatliches Gespräch mit dem Forschungsteam beendet.

1. Die Forscher begrüssten kürzlich ein neues Teammitglied, Dr. Davide Chicco, der an der Datenanalyse arbeiten wird.

2. Wir werden einen Betatest für Arbeitseinheiten ankündigen, die eine geringfügige Code-Änderung enthalten. Achtet auf eine baldige Ankündigung im Betatest Forum (noch keine genaue ETA).

3. Noch keine Antwort auf den im Update vom letzten Monat erwähnten Zuschussantrag.

Aktueller Status der Arbeitseinheiten:

Zum Herunterladen verfügbar: 828 Batches
In Bearbeitung: 830 Batches (6.862.542 Arbeitseinheiten)
Abgeschlossen: 64.121 Batches - 767 Batches in den letzten 30 Tagen - durchschnittlich 25 Batches pro Tag
Geschätzter Vorrat: 33 Tage

[Dennis-TW]

Hier die deutsche Übersetzung des August-Updates für MCM:

(Ab diesem Monat im neuen Format auf der News-Seite anstatt im WCG-Forum, die Einleitung lasse ich hier mal weg)

Lungenkrebs-Marker

Die erste Reihe von Arbeitseinheiten, die von Freiwilligen des World Community Grid bearbeitet wurden, half dem Forschungsteam bei der Suche nach Lungenkrebs-Markern. Seitdem hat das Forschungsteam die Daten analysiert, während es auch Daten für Arbeitseinheiten zu Eierstockkrebs auswertet und uns weiterhin Arbeitseinheiten zu Sarkomen schickt.

Die Forscher haben eine erste Zusammenfassung ihrer Erkenntnisse über Lungenkrebs-Signaturen zusammengestellt, und der Forschungsleiter wendet sich an seine Kollegen aus der klinischen Praxis, um ihre Meinung über die Bedeutung einiger Ergebnisse des Projekts einzuholen.

Beta-Tests an neuen Sarkom-Arbeitseinheiten

Das technische Team von World Community Grid hat sich um ein kleines Problem mit den kürzlich in Betrieb genommenen Beta Sarkom Arbeitseinheiten gekümmert. Möglicherweise führen wir in naher Zukunft einen zusätzlichen Betatest durch; wenn dies geschieht, werden wir eine Mitteilung in unserem Forum für Ankündigungen von Betatests veröffentlichen, so dass interessierte Freiwillige daran teilnehmen können. (Hier könnt ihr eure Einstellungen überprüfen, um zu sehen, ob ihr euch für den Betatest angemeldet haben).

Aktueller Status der Arbeitseinheiten

Zum Herunterladen verfügbar: 842 Batches
In Bearbeitung: 941 Batches (7.392.542 Arbeitseinheiten)
Abgeschlossen: 64.955 Batches (691 Batches in den letzten 30 Tagen,
durchschnittlich 23 Batches pro Tag)
Geschätzter Vorrat: 36 Tage

[Dennis-TW]

Hier die deutsche Übersetzung des September-Updates für MCM:

Lungenkrebs-Marker

Wie bereits im letzten Monatsbericht erwähnt, haben die Forscher damit begonnen, mit einigen ihrer Kollegen aus der klinischen Praxis zusammenzuarbeiten, um Input über die Bedeutung einiger der Ergebnisse des Projekts über Lungenkrebs-Marker zu erhalten. Dieser Prozess ist im Gange und könnte viele Monate dauern.

Sobald das Forschungsteam die Gespräche mit den Kollegen beendet hat, werden diese ihr Feedback in einen Forschungsbericht einfließen lassen.

Beta-Tests an neuen Sarkom-Arbeitseinheiten

Das World Community Grid Tech Team hofft, einen weiteren Betatest für neue Sarkom-Arbeitseinheiten durchführen zu können. Wenn dieser Beta-Test bereit ist, werden wir in unserem Forum für Beta-Test Ankündigungen eine Mitteilung veröffentlichen, damit interessierte Freiwillige daran teilnehmen können. Freiwillige können hier Ihre Einstellungen überprüfen, um zu sehen, ob sie sich für den Betatest angemeldet haben.

Aktueller Status der Arbeitseinheiten

Zum Herunterladen verfügbar: 844 Batches
In Bearbeitung: 889 Batches (7.152.542 Arbeitseinheiten)
Abgeschlossen: 65.645 Batches (749 Batches in den letzten 30 Tagen, Durchschnittlich 25 Batches pro Tag)
Geschätzter Vorrat: 33 Tage

[Dennis-TW]

Hier die deutsche Übersetzung des Oktober-Updates für MCM:

Informationen über neue Sarkom-Arbeitseinheiten

Mapping Cancer Markers hat Anfang dieses Jahres damit begonnen, Sarkom-Arbeitseinheiten im World Community Grid zu berechnen. Das Forschungsteam verfügt nun über Daten, die sieben Subtypen von Sarkomen umfassen. Sie haben einen neuen Typ von Arbeitseinheit mit einem Code erstellt, der es ihnen erlaubt, Unterschiede zwischen diesen Subtypen zu identifizieren.

Die Ergebnisse von früheren und aktuellen Sarkom-Arbeitseinheiten sind weiterhin gültig.

Betatests an neuen Sarkom-Arbeitseinheiten

Freiwillige Helfer des World Community Grid und das Technikteam haben kürzlich einen Betatest der oben beschriebenen neuen Arbeitseinheiten abgeschlossen. Diese Beta Arbeitseinheiten sind jetzt alle an das Forschungsteam zurückgegeben worden, das die Ergebnisse analysiert.

Aktueller Status der Arbeitseinheiten

Zum Herunterladen verfügbar: 710 Batches
In Bearbeitung: 1.047 Batches (9.212.542 Arbeitseinheiten)
Abgeschlossen: 66.671 Batches
934 Batches in den letzten 30 Tagen
Durchschnittlich 31 Batches pro Tag
Geschätzter Vorrat: 22 Tage

[Dennis-TW]

Hier die deutsche Übersetzung des November-Updates für MCM:

Untersuchung der Ergebnisse von Betatests an neuen Sarkom-Arbeitseinheiten

Das Forschungsteam hat die Analyse der Ergebnisse der Betatests abgeschlossen. Sie haben das World Community Grid Team gebeten, zusätzliche Tests durchzuführen, um die Ergebnisse des Betatests zu bestätigen. Wenn dafür ein zusätzlicher Betatest nötig ist, werden wir es allen mitteilen, so dass die Freiwilligen sicherstellen können, dass sie sich dafür angemeldet haben.

Lungenkrebs Forschungsbericht

Die Forscher arbeiten seit einiger Zeit an einem Bericht über ihre Lungenkrebsbefunde. Dazu gehörte auch die Zusammenarbeit mit ihren Kollegen, die im klinischen Bereich arbeiten, um den Bericht mit Inhalt zu füllen. Sie stehen nun kurz vor der Fertigstellung des endgültigen Entwurfs und planen, den Bericht in den nächsten Wochen bei Fachzeitschriften einzureichen, damit er zur Veröffentlichung in Betracht gezogen werden kann.

Aktueller Status der Arbeitseinheiten

Zum Herunterladen verfügbar: 872 Batches
In Bearbeitung: 1.066 Batches (64.982.542 Arbeitseinheiten)
Abgeschlossen: 67.506 Batches
908 Batches in den letzten 30 Tagen
Durchschnittlich 30,3 Batches pro Tag
Geschätzter Vorrat: 28 Tage

[Dennis-TW]

Hier die deutsche Übersetzung des Dezember-Updates für MCM:

Detailliertes Projektupdate von den Forschern

Anfang des Monats haben wir ein Update direkt vom Forschungsteam veröffentlicht, das ihr hier lesen können. In diesem Artikel erklärt das Team, wie eine relativ kleine Änderung des Codes eine große Auswirkung auf die Fähigkeit des Projekts haben könnte, Marker für verschiedene Arten von Sarkomen zu analysieren.

Weitere Feinabstimmung der neuen Sarkom Arbeitseinheiten

Das Forschungsteam hat die Analyse der Ergebnisse des Betatests für die neuen Sarkom Arbeitseinheiten abgeschlossen. Sie fanden einige kleinere Unterschiede zwischen ihren eigenen Test WUs und denen, die im World Community Grid ausgeführt wurden. Das World Community Grid Technik Team untersucht diese Unterschiede. Währenddessen wird viel Arbeit mit den bestehenden Sarkom Arbeitseinheiten verfügbar sein.

Aktueller Status der Arbeitseinheiten

Zum Herunterladen verfügbar: 799 Batches
In Bearbeitung: 1.066 Batches (64.982.542 Arbeitseinheiten)
Abgeschlossen: 68.465 Batches
1.007 Batches in den letzten 30 Tagen
Durchschnittlich 33,6 Batches pro Tag
Geschätzter Vorrat: 23 Tage