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  1. Avatar von Dennis-TW
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    #1

    Standard WCG: OpenPandemics

    WCG steht jetzt ebenfalls in den Startlöchern mit einem Projekt für den Kampf gegen Covid-19 und anderen Pandemien:

    Liebe Freiwillige,

    Heute hat IBM OpenPandemics, ein neues World Community Grid Projekt in Partnerschaft mit Scripps Research, angekündigt. Die Hauptziele dieses Projekts sind, sobald es gestartet ist:

    - Suche nach möglichen Behandlungsmethoden für COVID-19.
    - Entwicklung zusätzlicher Open-Source-Werkzeuge und Prozesse für die Arzneimittelentdeckung, die schnell zur Bekämpfung künftiger Pandemien und Epidemien eingesetzt werden können.

    World Community Grid hat hinter den Kulissen gearbeitet, um das Projekt so schnell wie möglich auf den Weg zu bringen, und wir werden euch während dieses Prozesses auf dem Laufenden halten. Sobald wir mit den Alpha-Tests beginnen (interne Tests von Arbeitseinheiten, die letztlich an die Computer der Freiwilligen geschickt werden), werden wir in diesem Thread eine Ankündigung machen. Wir werden diesen Thread auch mit Links zu Ankündigungen über Beta-Tests, den Projektstart und regelmäßige Projekt-Updates aktualisieren, so dass jeder, der das Forum besucht, schnell die neuesten Informationen finden kann.

    Um diese Ankündigungen für alle Forenbesucher so sichtbar wie möglich zu halten, wird dieser Thread gesperrt. Freiwillige werden ermutigt, über OpenPandemics in den folgenden Threads zu posten:

    Coming soon: OpenPandemics - Questions about science and technology
    Coming soon: OpenPandemics - Questions about work units and badges

    Außerdem werden wir unsere Kommunikationsrichtlinien, die ihr hier nachlesen könnt, strikt durchsetzen.

    Wir sind dankbar für jedermanns Unterstützung des World Community Grid und aller humanitären wissenschaftlichen Forschung. Jetzt stecken wir mehr denn je alle gemeinsam in dieser Sache.

    Vielen Dank,
    Juan
    Link zum Original
    Geändert von Dennis-TW (01.04.2020 um 14:31 Uhr)
    Grüße aus dem fernen Taiwan

  2. Die folgenden 9 Benutzer haben sich bei Dennis-TW bedankt für diesen nützlichen Beitrag:

    AxelS (13.04.2020), lugu (01.04.2020), Meiner Einer (03.04.2020), PinQuin (26.04.2020), Rainer Baumeister (09.04.2020), ShootY (02.04.2020), taurec (01.04.2020), Uwe-Bergstedt (02.04.2020), Walter Baumeister (04.04.2020)

  3. Avatar von WBT112
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    #2

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    Auch gerade gelesen. Bin gespannt wann es losgeht

  4. Avatar von Dennis-TW
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    #3

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    WCG pusht jetzt mal so richtig. So einen gelben Balken für ein anstehendes neues Projekt habe ich auf der WCG Homepage noch nie gesehen

    Klicken Sie auf die Grafik für eine größere Ansicht 

Name:	Anmerkung 2020-04-03 194303.jpg 
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ID:	6698
    Grüße aus dem fernen Taiwan

  5. Avatar von WBT112
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    #4

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    Ja ich hoffe, dass sie nächste Woche zumindest den Beta Test auf die Beine stellen.
    FAH und Rosetta konnten ja schon massiv profitieren, wäre schön wenn sich das WCG auch noch einreiht.

  6. Avatar von ToSp
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    #5

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    Ich werde mich dann auch wieder anschließen.

    Doch frage ich mich warum dann diese Wissenschaftler Scripps Research sich nicht bei Folding@Home oder Rosetta@Home anschließen?
    Warum muss man hier wieder eine "neues" Projekt starten?
    Warum kann man sich hier nicht mit Rosetta@Home zusammenschließen, eben weil R@H ja auch schon den BOINC benutzt und hier auch immer wieder die WUs ausgehen??
    Sind das denn alles so verschiedene Sachen die da berechnet werden und nicht in einem Projekt zusammengefasst werden können?

    Liebe Grüße
    Tobias

  7. Avatar von Urs
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    #6

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    Zitat Zitat von ToSp Beitrag anzeigen
    Sind das denn alles so verschiedene Sachen die da berechnet werden und nicht in einem Projekt zusammengefasst werden können?
    F@H und R@H beschäftigen sich mit der Faltung der Proteine. Wobei das Andocken eines Medi auch bei F@H eine Rolle spielt.
    WCG soll ein docking experiment werden. Ist also nicht dasselbe.

    Sich zusammen zutun ist nicht so einfach. Welche Software läuft auf den Servern, Wie sind die Aufgaben geskriptet usw. Das soll bei WCG ja auch auf win, linux mcos und android laufen. Unterschiedliche Programme/Software machen aber die Vergleichbarkeit ungenau und damit für die Wissenschaft wertlos.
    Immerhin will WCG darauf achten das sich die Berechnungen nicht mit anderen überschneiden.. So zumindest im Originalpost zu lesen.
    Geändert von Urs (05.04.2020 um 01:35 Uhr)

  8. Avatar von Dennis-TW
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    #7

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    Hier die offizielle Antwort:

    Folding@Home and Rosetta@Home are leveraging different computational research techniques - predicting the protein structure of the virus, whereas OpenPandemics will be predicting which chemical compounds dock against COVID-19 protein targets. Both approaches are valid and valuable.

    Folding@Home und Rosetta@Home nutzen verschiedene computergestützte Forschungstechniken - sie sagen die Proteinstruktur des Virus voraus, während OpenPandemics vorhersagen wird, welche chemischen Verbindungen an COVID-19 Protein-Ziele andocken. Beide Ansätze sind gültig und wertvoll.
    In anderen Worten: Folding und Rosetta versuchen herauszufinden, wie das jeweilige Schloss aussieht und WCG sucht nach dem passenden Schlüssel, um das Schloss zu knacken.
    Grüße aus dem fernen Taiwan

  9. Avatar von Urs
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    #8

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    Zitat Zitat von Dennis-TW Beitrag anzeigen
    In anderen Worten: Folding und Rosetta versuchen herauszufinden, wie das jeweilige Schloss aussieht und WCG sucht nach dem passenden Schlüssel, um das Schloss zu knacken.

    Eindeutig bessser erklährt!

  10. Avatar von ToSp
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    #9

    Cool

    Hallo zusammen

    Danke für die Erklärungen
    Dann hatte ich mich ja soweit richtig belesen.
    Fand es nur komisch dass sich halt die Entwickler da nicht zusammentun und man nicht alles über ein Projekt laufen kann.

    Wäre nämlich doof wenn es irgendwann mal zu einer Krankheut 20 verschiedene oder gleiche Projekte gibt und man dann nicht weiß wo man zuerst rechnen "soll".
    Wenn er versteht was ich meine

    Schönen Sonntag noch!

  11. Avatar von Urs
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    #10

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    Laut Aussage vom guten Uplinger (im Forum) hat die Alphaphase begonnen.

    Soll heissen das die Betaphase in kürze anschliesst.

    Ich lasse WCG also auf Empfang. In meinem Profil steht hstb 1 wu.

  12. Avatar von Dennis-TW
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    #11

    Standard

    Hier die übersetzte Meldung:

    Hallo,

    Ich möchte alle darüber informieren, dass wir mit dem Alpha-Test gegen das aktuelle COVID-19-Ziel begonnen haben. Wir haben einen Mustersatz von kleinen Liganden, die wir mit COVID-19 vergleichen können. Diese Alpha-Tests werden auf Geräten durchgeführt, die sich im Besitz von Mitgliedern des World Community Grid Teams befinden. Wir tun dies, um uns einen Eindruck davon zu verschaffen, ob die Binärdateien gut funktionieren und die Arbeitseinheiten nicht abstürzen. Bislang sieht es gut aus, während wir Probleme durcharbeiten. Die Alpha-Tests werden hoffentlich kurz sein, aber eines der Dinge, die wir testen, ist die Dimensionierung der Arbeitseinheiten, da verschiedene Liganden unterschiedlich lange brauchen, um fertig zu werden, manchmal exponentiell. Im Laufe des heutigen Tages wird eine größere Untermenge von Liganden in der Alpha getestet, um das Größenproblem zu lösen.

    Nochmals vielen Dank für euer Interesse und freuen uns auf eine baldige BETA :P
    -Uplinger
    Grüße aus dem fernen Taiwan

  13. Avatar von Rainer Baumeister
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    #12

    Standard

    Zitat Zitat von Dennis-TW Beitrag anzeigen
    Hier die offizielle Antwort:



    In anderen Worten: Folding und Rosetta versuchen herauszufinden, wie das jeweilige Schloss aussieht und WCG sucht nach dem passenden Schlüssel, um das Schloss zu knacken.
    Gut erklärt für einfache Leute wie mich.. :-)
    Danke Rainer
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  14. Avatar von WBT112
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    #13

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    Im Forum kann man sich schonmal den Bildschirmschoner ansehen. Das macht Hoffnung, dass es bald losgeht.

    Klicken Sie auf die Grafik für eine größere Ansicht 

Name:	opn1_screensaver_draft.png 
Hits:	32 
Größe:	131,8 KB 
ID:	6725

  15. Avatar von XSmeagolX
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    #14

    Standard

    hmmm... damit dürfte ja evtl. auch das Projektkürzel feststehen: opn1
    Aber bislang stehen noch keine Badges oder Logos zum Projekt online zur Verfügung.
    Nicht alles was der Kopf denkt, muss der Mensch auch umsetzen.
    Man muss auch mal Nein zu sich selbst sagen, zur Not übe es
    ...
    ------
    Meine Homepage :: Meine Gedichte :: Meine Stats :: Meine laufenden WU's :: Statistiken rund um unser Team SETI.Germany

  16. Avatar von Dennis-TW
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    #15

    Standard

    Soeben ist die erste Beta-WU bei mir eingetroffen:

    BETA_OPN1_TEST029_0032_0

    Laut Uplinger wird es erstmal langsam losgehen (800 WUs x 2) und er sich im Laufe des neuen Tages die Ergebnisse ansehen.
    Geändert von Dennis-TW (21.04.2020 um 05:14 Uhr)
    Grüße aus dem fernen Taiwan

  17. Avatar von Uwe-Bergstedt
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    #16

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    Ich habe auch eine bekommen:

    Project Name: Beta
    Created: 04/21/2020 00:28:42
    Name: BETA_OPN1_TEST029_0211
    Minimum Quorum: 2
    Replication: 2

  18. Avatar von Dennis-TW
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    #17

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    Hier noch ein paar genauere Infos:

    Hallo zusammen,

    Ein kurzes Update: Wir haben gerade mit einem ersten Betatest begonnen. Vorerst verwenden wir manuell erstellte Arbeitseinheiten, die auf ein Protein im Virus abzielen. Ziel dieses ersten Beta-Laufs ist es, die wissenschaftliche Anwendung (AutoDock), die Validierung der Ergebnisse und die Dimensionierung der Arbeitseinheiten zu testen. Die anfängliche Validierung wird mit Redundanz erfolgen (wobei wir zwei Kopien jeder Arbeitseinheit versenden), was uns helfen wird, zu bestätigen, dass der Validator gegen alle CPU-Typen innerhalb desselben Betriebssystems funktioniert. Zu Beginn sollte dieses Projekt jedoch ähnlich wie andere frühere AutoDock-basierte World Community Grid-Projekte laufen - d.h. neben stichprobenartigen Vergleichsprüfungen werden die Arbeitseinheiten ohne Vergleich/Redundanz laufen.

    In der Zwischenzeit testen wir die Automatisierung der Generierung von Arbeitseinheiten in unserer Alpha-Umgebung, und sobald diese Tests abgeschlossen sind, werden wir mit der automatischen Generierung von Arbeitseinheiten im Beta-Stadium fortfahren.

    Die neuesten Informationen zu diesem Betatest findet ihr im Thread: https://www.worldcommunitygrid.org/f...d_thread,42310

    Wenn ihr an diesem Test teilnehmen möchtet, stellt sicher, dass ihr euch hier für den Betatest angemeldet habt: https://www.worldcommunitygrid.org/m...etaProfiles.do.

    Vielen Dank für euer anhaltendes Interesse an OpenPandemics,

    Juan
    Grüße aus dem fernen Taiwan

  19. Avatar von WBT112
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    #18

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    So wie es aussieht könnte das neue Projekt auch Android und ARM on Linux unterstützen.

    Quelle: WCG Forum

  20. Avatar von Rainer Baumeister
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    #19

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    Das liest sich gut. Danke für den Beitrag!
    Meine kleinen Dinger werden schon geölt...
    Gruß Rainer
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  21. Avatar von Meiner Einer
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    #20

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    5 x sind bei mir die OPN-Betas gelandet.

    4 x Windows / 1 x Android.


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    #21

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    Es gibt erste Infos bezüglich Badges... soll wohl so aussehen (aktueller Entwurf) Klicken Sie auf die Grafik für eine größere Ansicht 

Name:	opn1_ffffff.jpg 
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    #22

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    So wie ich uplingers Post verstehe, dürfte der Start kurz bevor stehen.
    https://www.worldcommunitygrid.org/f...ad?post=625769

    EDIT:
    Soeben geht es los, erstes WUs sind da. Das Projekt läuft auch gleich zum Start auf ARM Prozessoren.
    Geändert von KodeX (14.05.2020 um 17:54 Uhr)
    Mitglied der WCG-Sekte

  24. Avatar von Flaeminger
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    #23

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    Danke!
    Voraussichtliche Laufzeit einer WU auf dem I3 3:31:22, also gut für den Büro-Laptop.
    Über Checkponits kann ich noch nichts sagen, der Umfang des Downloads hält sich in Grenzen, die Aufgaben werden an zwei Nutzer verschickt.

    Ich versuche jetzt mal die ersten drei.....
    … und steige dann wieder um auf den Pentathlon


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    #24

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    Hab auch eben dir ersten normalen Wu´s abbekommen

  26. Avatar von Defender
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    #25

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    Zitat Zitat von WBT112 Beitrag anzeigen
    So wie es aussieht könnte das neue Projekt auch Android und ARM on Linux unterstützen.

    Quelle: WCG Forum
    Ich habe es getestet und es stimmt. Mein Raspberry Pi 3B+ veranschlagt 10 Stunden für eine WU.
    - -
    Fairmondo: Gutes einfach entdecken - -Kiva: Loans that change lives

    „Nichts wird die Chance auf ein Überleben auf der Erde so steigern wie der Schritt zur vegetarischen Ernährung“ - Albert Einstein

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