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  1. Avatar von XSmeagolX
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    #26

    Standard OpenPandemics - COVID-19

    Original: https://www.worldcommunitygrid.org/r...n1/overview.do

    Problem
    COVID-19 ist eine Krankheit, die durch SARS-CoV-2, ein Virus aus der Familie der Coronaviren, verursacht wird. Diese Viren verursachen Krankheiten, die hauptsächlich das menschliche Atmungssystem und möglicherweise andere wichtige Organe befallen. COVID-19 kann zu schweren Erkrankungen oder sogar zum Tod führen.

    Zum Zeitpunkt des Starts dieses Projekts gibt es keine Behandlung, Heilung oder einen Impfstoff für COVID-19.

    Vorgeschlagene Lösung
    Wissenschaftler beim Scripps Research führen molekulare Modellierungssimulationen durch, um nach möglichen Kandidaten für die Entwicklung von Behandlungen für COVID-19 zu suchen, aber um erfolgreich zu sein, benötigen sie massive Rechenleistung, um Millionen von simulierten Laborexperimenten durchzuführen.

    Deshalb arbeitet Scripps Research mit World Community Grid zusammen, einer sozial ausgerichteten IBM-Initiative, die es jedem, der über einen Computer und eine Internetverbindung verfügt, ermöglicht, die Rechenleistung seines Geräts zu spenden, um Wissenschaftler bei der Untersuchung der weltweit größten Probleme in den Bereichen Gesundheit und Nachhaltigkeit zu unterstützen. Mit dieser gespendeten Rechenleistung wollen die Wissenschaftler vielversprechende chemische Verbindungen für weitere Labortests identifizieren.

    Das Forschungsteam will nicht nur bei der Suche nach Behandlungsmöglichkeiten für COVID-19 helfen, sondern auch ein schnell reagierendes Open-Source-Toolkit erstellen, das allen Wissenschaftlern bei der schnellen Suche nach Behandlungsmöglichkeiten für künftige Pandemien helfen soll. Im Einklang mit der Open-Data-Politik des World Community Grid stehen alle Daten und Werkzeuge, die im Rahmen dieses Projekts entwickelt werden, in der wissenschaftlichen Gemeinschaft frei zur Verfügung.

    Das Hauptziel des Projekts ist die Suche nach potenziellen Behandlungsmöglichkeiten für COVID-19, weshalb die Untersuchung von Proteinen von SARS-CoV-2 (dem Virus, das COVID-19 verursacht) höchste Priorität hat.

    Darüber hinaus wollen die Wissenschaftler nicht nur den aktuellen Notfall bekämpfen, sondern sich auch auf die wahrscheinlich folgenden vorbereiten. Künftige Pandemien könnten aus einer fortschreitenden Anhäufung von Mutationen entstehen, die schließlich zu einer neuen Virusvariante führen können. Dies geschah, als das Virus SARS-CoV-1 zu SARS-CoV-2 mutierte. Das Forschungsteam bezieht also Proteine des SARS-CoV-1-Virus und anderer Viren ein, die im Rahmen von OpenPandemics - COVID-19 untersucht werden sollen, um beurteilen zu können, wie schwierig es wäre, Moleküle zu finden oder zu entwerfen, die in der Lage sind, die unvermeidlichen Mutationen zu überwinden.

    Wie Du helfen kannst
    Als freiwilliger Teilnehmer am World Community Grid kannst du ein sicheres Softwareprogramm auf deinen Computer herunterladen. Und wenn dein Computer nicht seine volle Rechenleistung ausschöpft, führt er im Hintergrund automatisch ein simuliertes Experiment durch, mit dessen Hilfe die Wirksamkeit einer bestimmten chemischen Verbindung als mögliche Behandlung von COVID-19 vorhergesagt werden kann. Dann kontaktiert dein Computer den World Community Grid-Server, um ihn wissen zu lassen, dass er die Simulation abgeschlossen hat, die automatisch und sicher an uns zurückgeschickt wird.

    All dies geschieht unauffällig, während du deinen regulären Aktivitäten nachgehen, z.B. eine E-Mail tippen, im Internet surfen oder während dein Computer im Leerlauf ist, aber eingeschaltet bleibt.

    World Community Grid empfängt die Ergebnisse, die von dir zurückgesendet (oft als Arbeitseinheiten oder Forschungsaufgaben bezeichnet), kombiniert diese mit Hunderttausenden von Ergebnissen anderer Freiwilliger aus der ganzen Welt und sendet sie an das Scripps Research Team. Die Forscher beginnen dann mit der schwierigen Arbeit, die Daten zu analysieren. Dieser Prozess geschieht zwar nicht von heute auf morgen, aber er beschleunigt, was sonst viele Jahre dauern würde oder sogar unmöglich sein könnte.

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    Geändert von XSmeagolX (16.05.2020 um 11:20 Uhr) Grund: redaktionelle Änderungen

  2. Avatar von roundup
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    #27

    Standard

    Es geht los und "OpenPandemics - COVID 19" ist gestartet.
    https://www.worldcommunitygrid.org/f...d_thread,42374
    Nach dem Pentathlon setze ich 3 kleine Rechner darauf. Und danke @XSmeagolX für die Übersetzung!


  3. Avatar von aendgraend
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    #28

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    Es geht schon los
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  4. Avatar von Urs
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    #29

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    Wenn genug wus erfolgreich geechnet wurden wird ein Quorum 1 draus.


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    #30

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    Corona und ich werden wohl keine Freunde mehr beim Crunshen. Bei WCG Pandemics bekomme ich nach ca. 2 Dritteln und kurz vorm Ende Berechnungsfehler.
    Alles andere funzt. Kann also weder bei Rosetta, WCG oder Ibersivic (keine Checkpunkte) meinen Beitrag leisten.


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    #31

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    Zitat Zitat von MarceloBordon Beitrag anzeigen
    Corona und ich werden wohl keine Freunde mehr beim Crunshen. Bei WCG Pandemics bekomme ich nach ca. 2 Dritteln und kurz vorm Ende Berechnungsfehler.
    Alles andere funzt. Kann also weder bei Rosetta, WCG oder Ibersivic (keine Checkpunkte) meinen Beitrag leisten.
    Klingt für mich aber eher so als wenn dein Rechner irgendwelche Probleme hat, denn eigentlich gibt es normalerweise so gut wie keine Berechnungsfehler bei WCG. Im Forum habe ich da bisher auch noch nichts zu gelesen

    Und ibercivis hat checkpoints allerdings außerhalb der Boinc-Mechanik deshalb kann der client es wohl nicht anzeigen https://boinc.ibercivis.es/ibercivis...postid=297#297

  7. Avatar von ShootY
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    #32

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    Hier ist auch mein erstes Badge eingetroffen:
    == BoincStats | Rosetta@home | Folding@home | World Community Grid | GPUGrid | SETI@home | PrimeGrid | LAN-Community | patricksuttner.de ==
    “The universe is a pretty big place. If it's just us, seems like an awful waste of space.”
    ― Carl Sagan, Contact

  8. Avatar von AxelS
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    #33

    Standard

    @ShootY

    Für das Melden von Badges gibt es schon lange diesen "Faden" -> Klick mich!

  9. Avatar von ShootY
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    #34

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    Ja wusste ich, aber
    a) nicht mehr dran gedacht und
    b) war das mMn einfach Projektbezogen einfach hier reingeschreiben
    Sorry!
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  10. Avatar von Dennis-TW
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    #35

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    Und ab diesen Monat jetzt neu, hier die deutsche Übersetzung des Juni-Updates für OPN:

    Wir haben gerade unseren Anruf im Juni mit dem Forschungsteam beendet.

    1. Die Forscher haben damit begonnen, sich den ersten Batch an Daten anzusehen, den wir ihnen geschickt haben, und alles scheint gut zu sein.

    2. Sie haben hart an mehreren Förderanträgen gearbeitet, die jetzt alle eingesandt wurden.

    3. Sie planen, zusätzlich zu diesem Update ihre eigenen monatlichen Updates für die Freiwilligen zu erstellen. Weitere Informationen werden in den kommenden Wochen direkt von ihnen kommen.

    4. Die Forscher haben an einer GPU-Version von AutoDock gearbeitet, und ihre ersten Tests sind sehr gut verlaufen. Das technische Team von WCG wird nun mit seinen eigenen Tests beginnen und in Kürze weitere Informationen zur Verfügung stellen. Noch kein genauer Zeitplan - bleibt dran!

    5. Sie wurden eingeladen, zwei akademische Arbeiten im Zusammenhang mit dem Projekt zu schreiben - eine speziell über OpenPandemics und eine über AutoDock. Wir werden es alle wissen lassen, sobald diese veröffentlicht sind.

    Aktueller Status der Arbeitseinheiten:

    Zum Herunterladen verfügbar: 8.479 Batches
    In Bearbeitung: 1.941 Batches (15.362.727 Arbeitseinheiten)
    Abgeschlossen: 1.973 Batches insgesamt - 1.973 Batches in den letzten 30 Tagen - durchschnittlich 65 Batches pro Tag
    Geschätzter Vorrat: 130 Tage
    Grüße aus dem fernen Taiwan

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