SIMAP
Aus SETI.Germany Wiki
| SIMAP | |
|---|---|
 | |
| Ziel: | Berechne Ähnlichkeiten zwischen Proteinen |
| Kategorie: | Biologie |
| Homepage: | http://boincsimap.org/boincsimap/ |
| Betreiber: | TU München und Uni Wien  |
| Status: | inaktiv/beendet |
| SETI.Germany | |
| Forenthread: | SETI.Germany Forum |
SIMAP (Similarity Matrix of Proteins) ist ein Projekt der Technischen Universität München und verwendet im Moment zwei unterschiedliche Applikationen. Die eine (SIMAP) berechnet Ähnlichkeiten zwischen Proteinen. Die andere (HMMER) sucht in den Proteinsequenzen nach Mustern, also den Bausteinen aus denen Proteine aufgebaut sind und die bestimmte Funktionen tragen.
| Statistik | |
|---|---|
| Platzierung: | 5 |
| Punkte: | 207.812.828 |
Dieses Projekt ist zurzeit nicht als Hauptprojekt geeignet, da nur unregelmäßig (jeweils am Monatsanfang) ein größerer Schub WUs ausgegeben wird.
Erklärung der WU-Namen
Die Namen der WUs bei SIMAP haben das Format xxxxxxxx.yyyyyy_z.
xxxxxxxx ist der Batchname (siehe Batchmonitor).
yyyyyy ist die laufende Nummer der WUs in diesem Batch.
z gibt das Result an.
So ist z.B. 10020107.345497_0 das erste Result der 345497. WU aus Batch 10020107 (dem siebten Batch vom 01.02.2010).
Anwendungen zur manuellen Installation
Neben den vom Server automatisch verteilten Anwendungen (siehe Projektkasten rechts und Link 'Anwendungen' unten) bietet das Projekt eine große Zahl von Anwendungen unter anderem für ältere CPUs ohne SSE-Befehlssatz sowie für weitere Rechnerarchitekturen und Betriebssysteme. Diese müssen manuell installiert werden und stehen auf folgender Seite zum Download zur Verfügung: SIMAP and HMMER applications for i386 CPUs and UNIX (englisch)
